81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0796 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3811  protein of unknown function DUF222  97.23 
 
 		 593 aa  890    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4191  protein of unknown function DUF222  96.63 
 
 		 533 aa  1013    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.650463  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0796  protein of unknown function DUF222  100 
 
 		 534 aa  1083    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4658  hypothetical protein  96.74 
 
 		 275 aa  508  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4288  protein of unknown function DUF222  46.21 
 
 		 524 aa  346  8e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4824  protein of unknown function DUF222  41.94 
 
 		 553 aa  303  7.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2802  protein of unknown function DUF222  41.87 
 
 		 551 aa  292  1e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0845411  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3136  hypothetical protein  45.28 
 
 		 387 aa  258  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  35.56 
 
 		 448 aa  210  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  35.56 
 
 		 448 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  36.1 
 
 		 447 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  33.83 
 
 		 492 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  33.83 
 
 		 492 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  34.73 
 
 		 493 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  33.33 
 
 		 473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  33.33 
 
 		 444 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  34.07 
 
 		 489 aa  200  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  33.85 
 
 		 507 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  32.75 
 
 		 473 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  32.75 
 
 		 473 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  32.84 
 
 		 442 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  32.84 
 
 		 442 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  33.55 
 
 		 519 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  32.75 
 
 		 490 aa  197  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  33.95 
 
 		 507 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  33.95 
 
 		 507 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  33.19 
 
 		 507 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  33.19 
 
 		 507 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  33.19 
 
 		 507 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  32.84 
 
 		 444 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  32.84 
 
 		 444 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  36.23 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  36.23 
 
 		 492 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  34.41 
 
 		 519 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  36.48 
 
 		 451 aa  189  8e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  34.04 
 
 		 531 aa  185  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  33.7 
 
 		 506 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  31.28 
 
 		 540 aa  182  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  34.38 
 
 		 437 aa  180  5.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  31.98 
 
 		 552 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  34.07 
 
 		 501 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  32.98 
 
 		 532 aa  177  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  34.51 
 
 		 499 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  34.18 
 
 		 464 aa  170  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  35.26 
 
 		 454 aa  170  7e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  32.43 
 
 		 508 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  32.51 
 
 		 511 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  30.97 
 
 		 495 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  31.64 
 
 		 510 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  31.34 
 
 		 497 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  32.43 
 
 		 508 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  34.26 
 
 		 454 aa  163  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  29.82 
 
 		 518 aa  156  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  29.91 
 
 		 513 aa  154  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10095  hypothetical protein  42.59 
 
 		 317 aa  153  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5363  hypothetical protein  32.76 
 
 		 355 aa  143  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  28.3 
 
 		 432 aa  108  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11604  REP13E12 repeat-containing protein  41.71 
 
 		 240 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.81222e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13504  hypothetical protein  41.71 
 
 		 239 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  29.35 
 
 		 442 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  32.93 
 
 		 469 aa  75.5  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  27.33 
 
 		 485 aa  73.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  24.93 
 
 		 546 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  25 
 
 		 561 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  28 
 
 		 494 aa  55.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  22.4 
 
 		 572 aa  55.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  30.94 
 
 		 661 aa  53.9  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  25.29 
 
 		 414 aa  53.5  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  25.69 
 
 		 505 aa  52.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  30.27 
 
 		 407 aa  50.4  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  30.56 
 
 		 627 aa  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  30.48 
 
 		 469 aa  49.3  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  29.73 
 
 		 413 aa  47  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1508  HNH endonuclease  27.52 
 
 		 436 aa  47  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000388947  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  28.11 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  26.73 
 
 		 464 aa  45.8  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3314  hypothetical protein  24.78 
 
 		 526 aa  46.2  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0608226  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  24.67 
 
 		 414 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5365  hypothetical protein  44.44 
 
 		 158 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  28.87 
 
 		 391 aa  44.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2460  HNH endonuclease  28.86 
 
 		 428 aa  44.3  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>