More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3776 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3776  iojap-like protein  100 
 
 
128 aa  261  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  3.07395e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3860  iojap-like protein  97.66 
 
 
128 aa  258  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  72.22 
 
 
128 aa  191  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  4.89424e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3209  iojap-related protein  67.46 
 
 
131 aa  177  6e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.013969  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3201  Iojap-related protein  64.29 
 
 
131 aa  172  1e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.12867e-19  unclonable  7.41028e-24 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3613  iojap-like protein  54.7 
 
 
135 aa  141  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  2.08423e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3631  iojap-like protein  47.41 
 
 
138 aa  125  1e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  9.86152e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2577  Iojap-related protein  46.09 
 
 
119 aa  117  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.56032e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  44.83 
 
 
150 aa  107  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  6.75973e-07  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0213  Iojap-related protein  47.62 
 
 
107 aa  107  8e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277011  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0237  iojap-like protein  47.96 
 
 
198 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  47.96 
 
 
198 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0228  iojap-like protein  44.55 
 
 
191 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  0.307872 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1601  iojap-related protein  42.74 
 
 
118 aa  99  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  6.67428e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  44 
 
 
118 aa  96.7  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  2.07265e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  44.95 
 
 
117 aa  96.7  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  45.26 
 
 
114 aa  96.3  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0097  Iojap-related protein  37.39 
 
 
131 aa  93.6  8e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0187008  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2664  iojap-like protein  37.72 
 
 
131 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000901507  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0095  iojap-like protein  37.61 
 
 
131 aa  91.3  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  2.7247e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0087  Iojap-related protein  39.29 
 
 
129 aa  90.5  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755827  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2674  iojap-like protein  40.37 
 
 
124 aa  90.5  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0269937  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0735  Iojap-related protein  40.17 
 
 
152 aa  90.1  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130458  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  40.57 
 
 
122 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3346  iojap-like protein  40.2 
 
 
226 aa  88.6  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  2.42927e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3118  iojap-like protein  38.39 
 
 
144 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  42.86 
 
 
124 aa  88.6  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  36.61 
 
 
118 aa  87.8  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  4.2805e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2454  iojap-like protein  40.35 
 
 
118 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.49181e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3002  iojap-like protein  37.5 
 
 
144 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2006  iojap-like protein  38.66 
 
 
142 aa  87  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0014366  hitchhiker  3.65534e-11 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0432  iojap-like protein  38.46 
 
 
166 aa  87.4  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  39.78 
 
 
114 aa  87  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  5.74363e-11  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  41.51 
 
 
118 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1756  Iojap-related protein  39.29 
 
 
131 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  6.63767e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  41.51 
 
 
118 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  43.4 
 
 
158 aa  86.3  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  2.89548e-09  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0124  iojap-like protein  37.5 
 
 
143 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  2.25979e-08  hitchhiker  0.00822144 
 
 
-
 
NC_002936  DET0393  iojap-like protein  38.46 
 
 
114 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00274134  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  42.86 
 
 
115 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.23789e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  42.05 
 
 
115 aa  86.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0372  iojap-like protein  38.46 
 
 
114 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  4.45596e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0022  Iojap-related protein  41.75 
 
 
163 aa  85.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  41.05 
 
 
118 aa  85.5  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  1.39024e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0136  iojap-like protein  38.32 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.872852  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1159  iojap-related protein  38.89 
 
 
117 aa  84.7  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_335  hypothetical protein  37.5 
 
 
116 aa  84.7  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  5.06445e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  39.62 
 
 
117 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0986  iojap-like protein  40.78 
 
 
120 aa  85.1  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.254875  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0102  iojap-like protein  38.98 
 
 
131 aa  84.3  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.01684e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4228  iojap-related protein  42.11 
 
 
118 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  3.23134e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4556  iojap-related protein  42.11 
 
 
118 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  1.07806e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3056  iojap-like protein  42.11 
 
 
118 aa  84.3  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000232499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0787  iojap-related protein  42.11 
 
 
118 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  7.1595e-08  hitchhiker  1.38621e-06 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  39.8 
 
 
113 aa  84.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4450  iojap-related protein  42.11 
 
 
118 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0295288  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4411  iojap-related protein  42.11 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0836383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4076  iojap-related protein  42.11 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  2.93892e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4066  iojap-related protein  42.11 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  2.08408e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4352  iojap-related protein  42.11 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00200465 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0977  Iojap-related protein  38.38 
 
 
116 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4463  iojap-related protein  42.11 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.313e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1058  iojap-like protein  43.82 
 
 
159 aa  84  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3248  iojap-like protein  36.11 
 
 
125 aa  84  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  2.5477e-09  unclonable  1.42145e-05 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2440  Iojap-related protein  46.07 
 
 
117 aa  84  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1774  iojap-related protein  40.2 
 
 
156 aa  84  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4181  iojap-like protein  41.05 
 
 
118 aa  84  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  6.80321e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0567  Iojap-related protein  42.59 
 
 
115 aa  84  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4278  hypothetical protein  38.84 
 
 
137 aa  84  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1328  hypothetical protein  38.71 
 
 
112 aa  83.6  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  38.26 
 
 
158 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  40.95 
 
 
158 aa  83.6  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  38.26 
 
 
139 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0377  Iojap-related protein  42.73 
 
 
153 aa  83.6  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  38.26 
 
 
139 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1783  iojap-like protein  36.27 
 
 
144 aa  82.8  1e-15  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0164  Iojap-related protein  40.86 
 
 
139 aa  83.2  1e-15  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3737  iojap-like protein  37.37 
 
 
104 aa  83.2  1e-15  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  6.9668e-06  unclonable  1.98678e-10 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0536  iojap-like protein  39.13 
 
 
114 aa  83.2  1e-15  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.635311 
 
 
-
 
NC_004310  BR1841  iojap-related protein  40.2 
 
 
117 aa  83.2  1e-15  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1253  iojap-like protein  42.27 
 
 
110 aa  82.8  1e-15  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00407148  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  38.26 
 
 
166 aa  83.2  1e-15  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1332  hypothetical protein  38.71 
 
 
112 aa  83.2  1e-15  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  40.86 
 
 
118 aa  83.2  1e-15  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2506  Iojap-related protein  43.01 
 
 
119 aa  82  2e-15  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  40.43 
 
 
148 aa  82  2e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0170  Iojap-related protein  39.78 
 
 
121 aa  82  2e-15  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13380  iojap-like protein  45.56 
 
 
121 aa  82.8  2e-15  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.129259  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  43.82 
 
 
120 aa  81.6  3e-15  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  37.74 
 
 
123 aa  81.6  3e-15  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4206  iojap-like protein  37.61 
 
 
149 aa  81.6  3e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573117  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2013  iojap-like protein  37.84 
 
 
117 aa  82  3e-15  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1684  hypothetical protein  41.94 
 
 
117 aa  81.6  3e-15  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0432873  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1641  iojap-like protein  37.61 
 
 
141 aa  81.6  3e-15  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660201 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0577  Iojap-related protein  50.67 
 
 
132 aa  81.6  3e-15  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.258721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4552  iojap-like protein  37.39 
 
 
138 aa  82  3e-15  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.67264  normal  0.570489 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1649  hypothetical protein  41.94 
 
 
117 aa  81.6  3e-15  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  46.74 
 
 
164 aa  82  3e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3882  iojap-like protein  38.26 
 
 
147 aa  82  3e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.604343  normal  0.0302517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5041  iojap-like protein  41.49 
 
 
127 aa  81.3  4e-15  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>