33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3267 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0982  hypothetical protein  98.23 
 
 		 396 aa  811    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.364369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3267  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  821    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000221344  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4315  hypothetical protein  62.08 
 
 		 391 aa  518  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433382  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0185  hypothetical protein  58.7 
 
 		 388 aa  483  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0185376  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0133  hypothetical protein  58.96 
 
 		 388 aa  482  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.957824  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0179  hypothetical protein  56.95 
 
 		 385 aa  435  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000153754  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2955  hypothetical protein  47.15 
 
 		 389 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1009  hypothetical protein  41.97 
 
 		 389 aa  310  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000550438  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3240  hypothetical protein  36.46 
 
 		 209 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3771  hypothetical protein  24.49 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000659386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0918  hypothetical protein  34.34 
 
 		 205 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.254108 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0781  hypothetical protein  32.83 
 
 		 204 aa  100  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2004  hypothetical protein  33.16 
 
 		 204 aa  99.8  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2005  hypothetical protein  28.49 
 
 		 179 aa  97.8  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1212  hypothetical protein  31.82 
 
 		 207 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2591  hypothetical protein  29.69 
 
 		 204 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2592  hypothetical protein  29.41 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0780  hypothetical protein  28.4 
 
 		 176 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.348811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0919  hypothetical protein  26.04 
 
 		 178 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.421606 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2130  hypothetical protein  29.44 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222801  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1213  hypothetical protein  28.82 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3239  hypothetical protein  30.81 
 
 		 173 aa  75.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1688  hypothetical protein  28.05 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2129  hypothetical protein  25.58 
 
 		 173 aa  61.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.731903  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1758  hypothetical protein  24.54 
 
 		 228 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4757  hypothetical protein  28.65 
 
 		 235 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0253714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2117  hypothetical protein  23.61 
 
 		 225 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1840  hypothetical protein  23.46 
 
 		 212 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592101  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1689  hypothetical protein  21.35 
 
 		 212 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1759  hypothetical protein  24.4 
 
 		 211 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2116  hypothetical protein  26.73 
 
 		 224 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4758  hypothetical protein  23.2 
 
 		 207 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0367498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1841  hypothetical protein  25.74 
 
 		 236 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>