31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2955 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2955  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  793    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1009  hypothetical protein  55.13 
 
 
389 aa  420  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000550438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4315  hypothetical protein  51.81 
 
 
391 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433382  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0133  hypothetical protein  48.59 
 
 
388 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.957824  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0179  hypothetical protein  49.87 
 
 
385 aa  393  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000153754  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0185  hypothetical protein  47.56 
 
 
388 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0185376  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3267  hypothetical protein  47.41 
 
 
396 aa  386  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000221344  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0982  hypothetical protein  47.15 
 
 
396 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.364369 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3771  hypothetical protein  26.45 
 
 
389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000659386  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2004  hypothetical protein  36.32 
 
 
204 aa  112  9e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0918  hypothetical protein  35 
 
 
205 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.254108 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3240  hypothetical protein  37.11 
 
 
209 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2005  hypothetical protein  32.95 
 
 
179 aa  104  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2591  hypothetical protein  36.5 
 
 
204 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0781  hypothetical protein  33 
 
 
204 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474074  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1212  hypothetical protein  33.17 
 
 
207 aa  92.8  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0780  hypothetical protein  35.26 
 
 
176 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.348811  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2592  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0919  hypothetical protein  29.24 
 
 
178 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.421606 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1213  hypothetical protein  31.4 
 
 
175 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3239  hypothetical protein  28.49 
 
 
173 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2130  hypothetical protein  27.96 
 
 
204 aa  69.3  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222801  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4758  hypothetical protein  26.76 
 
 
207 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0367498  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1758  hypothetical protein  27.07 
 
 
228 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2117  hypothetical protein  27.07 
 
 
225 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1840  hypothetical protein  27.07 
 
 
212 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592101  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2129  hypothetical protein  25.27 
 
 
173 aa  56.2  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.731903  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1689  hypothetical protein  23.71 
 
 
212 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4757  hypothetical protein  24.86 
 
 
235 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0253714  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1759  hypothetical protein  23.62 
 
 
211 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1841  hypothetical protein  23.12 
 
 
236 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>