32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0185 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0185  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  793    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0185376  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0133  hypothetical protein  89.43 
 
 		 388 aa  717    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.957824  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4315  hypothetical protein  73.64 
 
 		 391 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0982  hypothetical protein  59.48 
 
 		 396 aa  487  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.364369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3267  hypothetical protein  58.7 
 
 		 396 aa  483  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000221344  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0179  hypothetical protein  55.61 
 
 		 385 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000153754  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2955  hypothetical protein  47.3 
 
 		 389 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1009  hypothetical protein  44.22 
 
 		 389 aa  323  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000550438  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3771  hypothetical protein  28.03 
 
 		 389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000659386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2591  hypothetical protein  35.12 
 
 		 204 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2005  hypothetical protein  34.25 
 
 		 179 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3240  hypothetical protein  36 
 
 		 209 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0918  hypothetical protein  33.33 
 
 		 205 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.254108 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0781  hypothetical protein  31.66 
 
 		 204 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2004  hypothetical protein  35.68 
 
 		 204 aa  110  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1212  hypothetical protein  32.64 
 
 		 207 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0919  hypothetical protein  30.23 
 
 		 178 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.421606 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2592  hypothetical protein  32.16 
 
 		 177 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0780  hypothetical protein  31.58 
 
 		 176 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.348811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3239  hypothetical protein  28.82 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1213  hypothetical protein  31.21 
 
 		 175 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2129  hypothetical protein  27.75 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.731903  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2130  hypothetical protein  28.65 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222801  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1688  hypothetical protein  31.25 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4757  hypothetical protein  29.95 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0253714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1689  hypothetical protein  24.87 
 
 		 212 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4758  hypothetical protein  27.22 
 
 		 207 aa  57  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0367498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1758  hypothetical protein  26.67 
 
 		 228 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1840  hypothetical protein  26.06 
 
 		 212 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592101  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2117  hypothetical protein  26.06 
 
 		 225 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1759  hypothetical protein  24 
 
 		 211 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2116  hypothetical protein  30.97 
 
 		 224 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>