20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4757 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4757  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0253714  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1688  hypothetical protein  50 
 
 
212 aa  201  6e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1841  hypothetical protein  45.37 
 
 
236 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2116  hypothetical protein  44.39 
 
 
224 aa  165  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1759  hypothetical protein  44.5 
 
 
211 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1009  hypothetical protein  27.1 
 
 
389 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000550438  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2004  hypothetical protein  27.96 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4315  hypothetical protein  29.85 
 
 
391 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433382  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0185  hypothetical protein  29.95 
 
 
388 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0185376  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2591  hypothetical protein  25.65 
 
 
204 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0982  hypothetical protein  28.65 
 
 
396 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.364369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3267  hypothetical protein  28.65 
 
 
396 aa  55.5  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000221344  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0133  hypothetical protein  29.63 
 
 
388 aa  55.5  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.957824  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0918  hypothetical protein  28.49 
 
 
205 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.254108 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3240  hypothetical protein  24.73 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3771  hypothetical protein  25.58 
 
 
389 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000659386  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1212  hypothetical protein  24.73 
 
 
207 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2955  hypothetical protein  24.86 
 
 
389 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0179  hypothetical protein  27.66 
 
 
385 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000153754  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0781  hypothetical protein  23.53 
 
 
204 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474074  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>