21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2004 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2004  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  422  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0918  hypothetical protein  60.5 
 
 
205 aa  258  4e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.254108 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2591  hypothetical protein  57.64 
 
 
204 aa  256  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3240  hypothetical protein  57.71 
 
 
209 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0781  hypothetical protein  55.78 
 
 
204 aa  245  4e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474074  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1212  hypothetical protein  51.26 
 
 
207 aa  218  6e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2955  hypothetical protein  37.1 
 
 
389 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0185  hypothetical protein  35.68 
 
 
388 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0185376  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2130  hypothetical protein  32.79 
 
 
204 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222801  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0179  hypothetical protein  35.94 
 
 
385 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000153754  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4315  hypothetical protein  35.82 
 
 
391 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433382  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3771  hypothetical protein  31.79 
 
 
389 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000659386  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0133  hypothetical protein  34.83 
 
 
388 aa  105  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.957824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0982  hypothetical protein  33 
 
 
396 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.364369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3267  hypothetical protein  33.16 
 
 
396 aa  99.8  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000221344  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1009  hypothetical protein  31.68 
 
 
389 aa  96.7  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000550438  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4757  hypothetical protein  27.96 
 
 
235 aa  63.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0253714  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1688  hypothetical protein  22.99 
 
 
212 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1841  hypothetical protein  22.22 
 
 
236 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2116  hypothetical protein  22.22 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1759  hypothetical protein  23.81 
 
 
211 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>