30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0133 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0185  hypothetical protein  89.43 
 
 		 388 aa  717    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0185376  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0133  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  792    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.957824  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4315  hypothetical protein  74.94 
 
 		 391 aa  610  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0982  hypothetical protein  59.22 
 
 		 396 aa  483  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.364369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3267  hypothetical protein  58.96 
 
 		 396 aa  482  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000221344  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0179  hypothetical protein  58.29 
 
 		 385 aa  442  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000153754  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2955  hypothetical protein  48.33 
 
 		 389 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1009  hypothetical protein  44.99 
 
 		 389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000550438  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3771  hypothetical protein  27.55 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000659386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2005  hypothetical protein  34.25 
 
 		 179 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0918  hypothetical protein  34.2 
 
 		 205 aa  117  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.254108 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3240  hypothetical protein  33.67 
 
 		 209 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2591  hypothetical protein  32.68 
 
 		 204 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0781  hypothetical protein  31.66 
 
 		 204 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2004  hypothetical protein  34.83 
 
 		 204 aa  105  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1212  hypothetical protein  33.68 
 
 		 207 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2592  hypothetical protein  32.16 
 
 		 177 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0780  hypothetical protein  29.59 
 
 		 176 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.348811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0919  hypothetical protein  30.23 
 
 		 178 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.421606 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3239  hypothetical protein  31.18 
 
 		 173 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1213  hypothetical protein  31.76 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2129  hypothetical protein  28.32 
 
 		 173 aa  71.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.731903  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2130  hypothetical protein  28.65 
 
 		 204 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222801  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4758  hypothetical protein  26.11 
 
 		 207 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0367498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1689  hypothetical protein  26.98 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4757  hypothetical protein  29.63 
 
 		 235 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0253714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1688  hypothetical protein  28.1 
 
 		 212 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1758  hypothetical protein  25.28 
 
 		 228 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2117  hypothetical protein  24.72 
 
 		 225 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1840  hypothetical protein  24.72 
 
 		 212 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>