21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2129 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2129  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  349  1e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.731903  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2592  hypothetical protein  34.36 
 
 
177 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0780  hypothetical protein  33.96 
 
 
176 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.348811  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2005  hypothetical protein  33.33 
 
 
179 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0919  hypothetical protein  32.92 
 
 
178 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.421606 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3239  hypothetical protein  31.25 
 
 
173 aa  92  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1213  hypothetical protein  31.45 
 
 
175 aa  88.6  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3771  hypothetical protein  32.74 
 
 
389 aa  85.9  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000659386  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4315  hypothetical protein  29.31 
 
 
391 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433382  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0133  hypothetical protein  28.32 
 
 
388 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.957824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0185  hypothetical protein  27.75 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0185376  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1758  hypothetical protein  26.38 
 
 
228 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1840  hypothetical protein  25.77 
 
 
212 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592101  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2117  hypothetical protein  25.77 
 
 
225 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0982  hypothetical protein  25.58 
 
 
396 aa  61.6  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.364369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3267  hypothetical protein  25.58 
 
 
396 aa  61.2  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000221344  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4758  hypothetical protein  25.61 
 
 
207 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0367498  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1689  hypothetical protein  26.58 
 
 
212 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2955  hypothetical protein  25.27 
 
 
389 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1009  hypothetical protein  23.78 
 
 
389 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000550438  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0179  hypothetical protein  24.68 
 
 
385 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000153754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>