32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4315 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4315  hypothetical protein  100 
 
 
391 aa  798    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433382  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0133  hypothetical protein  74.94 
 
 
388 aa  610  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.957824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0185  hypothetical protein  73.64 
 
 
388 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0185376  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3267  hypothetical protein  62.08 
 
 
396 aa  518  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000221344  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0982  hypothetical protein  62.08 
 
 
396 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.364369 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0179  hypothetical protein  58.82 
 
 
385 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000153754  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2955  hypothetical protein  51.55 
 
 
389 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1009  hypothetical protein  45.01 
 
 
389 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000550438  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3771  hypothetical protein  28.21 
 
 
389 aa  132  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000659386  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3240  hypothetical protein  36.18 
 
 
209 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0918  hypothetical protein  33.17 
 
 
205 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.254108 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2591  hypothetical protein  34.5 
 
 
204 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2004  hypothetical protein  35.82 
 
 
204 aa  106  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0781  hypothetical protein  33.17 
 
 
204 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474074  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2005  hypothetical protein  31.49 
 
 
179 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2592  hypothetical protein  34.48 
 
 
177 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1212  hypothetical protein  31.34 
 
 
207 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0780  hypothetical protein  31.58 
 
 
176 aa  90.1  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.348811  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0919  hypothetical protein  28.4 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.421606 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3239  hypothetical protein  27.81 
 
 
173 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1213  hypothetical protein  33.14 
 
 
175 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2129  hypothetical protein  29.31 
 
 
173 aa  75.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.731903  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2130  hypothetical protein  28.12 
 
 
204 aa  69.3  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222801  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4757  hypothetical protein  29.85 
 
 
235 aa  60.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0253714  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1758  hypothetical protein  28.24 
 
 
228 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1688  hypothetical protein  27.6 
 
 
212 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1689  hypothetical protein  24.49 
 
 
212 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2117  hypothetical protein  26.91 
 
 
225 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1840  hypothetical protein  26.98 
 
 
212 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592101  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4758  hypothetical protein  25.75 
 
 
207 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0367498  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2116  hypothetical protein  24.77 
 
 
224 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1759  hypothetical protein  24.16 
 
 
211 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>