30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0179 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0179  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  787    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000153754  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4315  hypothetical protein  58.82 
 
 
391 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433382  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0133  hypothetical protein  58.29 
 
 
388 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.957824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0982  hypothetical protein  56.95 
 
 
396 aa  435  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.364369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3267  hypothetical protein  56.95 
 
 
396 aa  435  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000221344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0185  hypothetical protein  55.61 
 
 
388 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0185376  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2955  hypothetical protein  49.6 
 
 
389 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1009  hypothetical protein  46.46 
 
 
389 aa  325  6e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000550438  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3771  hypothetical protein  27.39 
 
 
389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000659386  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2004  hypothetical protein  35.94 
 
 
204 aa  107  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3240  hypothetical protein  33.82 
 
 
209 aa  106  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0918  hypothetical protein  32.51 
 
 
205 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.254108 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0781  hypothetical protein  31 
 
 
204 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474074  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2005  hypothetical protein  33.75 
 
 
179 aa  94.4  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2591  hypothetical protein  30.21 
 
 
204 aa  93.2  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1212  hypothetical protein  32.35 
 
 
207 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0780  hypothetical protein  31.65 
 
 
176 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.348811  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2130  hypothetical protein  30.05 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222801  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2592  hypothetical protein  31.61 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0919  hypothetical protein  29.48 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.421606 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1213  hypothetical protein  32.93 
 
 
175 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3239  hypothetical protein  24.69 
 
 
173 aa  60.8  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1688  hypothetical protein  26.98 
 
 
212 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1689  hypothetical protein  28.31 
 
 
212 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4757  hypothetical protein  27.66 
 
 
235 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0253714  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4758  hypothetical protein  26.19 
 
 
207 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0367498  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1758  hypothetical protein  28.48 
 
 
228 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2129  hypothetical protein  24.68 
 
 
173 aa  46.2  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.731903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1840  hypothetical protein  27.27 
 
 
212 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592101  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2117  hypothetical protein  27.27 
 
 
225 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>