21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2005 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2005  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  366  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3239  hypothetical protein  56.73 
 
 
173 aa  209  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2592  hypothetical protein  56.89 
 
 
177 aa  193  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0780  hypothetical protein  55.49 
 
 
176 aa  191  6e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.348811  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0919  hypothetical protein  52.73 
 
 
178 aa  168  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.421606 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1213  hypothetical protein  48.15 
 
 
175 aa  147  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0185  hypothetical protein  34.25 
 
 
388 aa  119  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0185376  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0133  hypothetical protein  34.25 
 
 
388 aa  117  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.957824  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4315  hypothetical protein  31.49 
 
 
391 aa  105  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433382  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3771  hypothetical protein  38.46 
 
 
389 aa  104  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000659386  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2129  hypothetical protein  33.33 
 
 
173 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.731903  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2955  hypothetical protein  32.95 
 
 
389 aa  98.2  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3267  hypothetical protein  28.49 
 
 
396 aa  97.8  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000221344  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0982  hypothetical protein  27.91 
 
 
396 aa  96.3  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.364369 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1009  hypothetical protein  38.1 
 
 
389 aa  94.4  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000550438  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0179  hypothetical protein  33.75 
 
 
385 aa  94.4  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000153754  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1689  hypothetical protein  30 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4758  hypothetical protein  28.48 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0367498  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1758  hypothetical protein  30.12 
 
 
228 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1840  hypothetical protein  28.66 
 
 
212 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592101  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2117  hypothetical protein  28.66 
 
 
225 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>