33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1009 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1009  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  791    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000550438  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2955  hypothetical protein  54.87 
 
 
389 aa  411  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4315  hypothetical protein  45.01 
 
 
391 aa  350  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433382  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0179  hypothetical protein  46.46 
 
 
385 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000153754  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0133  hypothetical protein  44.99 
 
 
388 aa  338  8e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.957824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0185  hypothetical protein  44.22 
 
 
388 aa  336  5e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0185376  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0982  hypothetical protein  41.97 
 
 
396 aa  325  7e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.364369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3267  hypothetical protein  41.97 
 
 
396 aa  323  4e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000221344  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3771  hypothetical protein  26.03 
 
 
389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000659386  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2005  hypothetical protein  38.1 
 
 
179 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0918  hypothetical protein  32.51 
 
 
205 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.254108 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2004  hypothetical protein  31.68 
 
 
204 aa  96.7  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2591  hypothetical protein  32.51 
 
 
204 aa  96.3  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0780  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  93.6  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.348811  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1212  hypothetical protein  33.66 
 
 
207 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0919  hypothetical protein  31.76 
 
 
178 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.421606 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3240  hypothetical protein  33.17 
 
 
209 aa  91.3  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2592  hypothetical protein  33.53 
 
 
177 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3239  hypothetical protein  34.12 
 
 
173 aa  87  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1213  hypothetical protein  33.14 
 
 
175 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0781  hypothetical protein  28.5 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474074  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2130  hypothetical protein  28.06 
 
 
204 aa  75.1  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222801  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4757  hypothetical protein  27.1 
 
 
235 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0253714  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4758  hypothetical protein  27.96 
 
 
207 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0367498  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1840  hypothetical protein  24.58 
 
 
212 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592101  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2117  hypothetical protein  24.58 
 
 
225 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2129  hypothetical protein  23.7 
 
 
173 aa  53.1  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.731903  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1759  hypothetical protein  26.95 
 
 
211 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1758  hypothetical protein  25.14 
 
 
228 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1841  hypothetical protein  24.55 
 
 
236 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2116  hypothetical protein  24.55 
 
 
224 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1689  hypothetical protein  23.86 
 
 
212 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1688  hypothetical protein  23.03 
 
 
212 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>