21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0780 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0780  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  356  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.348811  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2592  hypothetical protein  74.57 
 
 
177 aa  274  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0919  hypothetical protein  76.4 
 
 
178 aa  262  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.421606 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1213  hypothetical protein  61.27 
 
 
175 aa  206  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2005  hypothetical protein  55.49 
 
 
179 aa  191  6e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3239  hypothetical protein  53.29 
 
 
173 aa  187  7e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2129  hypothetical protein  33.96 
 
 
173 aa  105  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.731903  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3771  hypothetical protein  34.16 
 
 
389 aa  91.7  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000659386  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4315  hypothetical protein  31.58 
 
 
391 aa  90.1  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433382  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0133  hypothetical protein  29.59 
 
 
388 aa  89.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.957824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0185  hypothetical protein  31.58 
 
 
388 aa  88.2  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0185376  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2955  hypothetical protein  35.26 
 
 
389 aa  84  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1009  hypothetical protein  33.33 
 
 
389 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000550438  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3267  hypothetical protein  28.4 
 
 
396 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000221344  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0982  hypothetical protein  28.4 
 
 
396 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.364369 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0179  hypothetical protein  31.65 
 
 
385 aa  78.2  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000153754  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1689  hypothetical protein  31.01 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1840  hypothetical protein  31.68 
 
 
212 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592101  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1758  hypothetical protein  31.06 
 
 
228 aa  62  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2117  hypothetical protein  31.06 
 
 
225 aa  61.6  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4758  hypothetical protein  30.06 
 
 
207 aa  59.7  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0367498  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>