21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1840 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1840  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592101  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2117  hypothetical protein  99.53 
 
 
225 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1758  hypothetical protein  95.28 
 
 
228 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1689  hypothetical protein  67.88 
 
 
212 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4758  hypothetical protein  61.78 
 
 
207 aa  234  5.0000000000000005e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0367498  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1213  hypothetical protein  33.54 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3239  hypothetical protein  28.4 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3771  hypothetical protein  29.28 
 
 
389 aa  64.3  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000659386  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0919  hypothetical protein  30.3 
 
 
178 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.421606 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0780  hypothetical protein  31.68 
 
 
176 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.348811  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2129  hypothetical protein  25.77 
 
 
173 aa  62.4  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.731903  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2592  hypothetical protein  27.67 
 
 
177 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2005  hypothetical protein  28.66 
 
 
179 aa  58.9  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4315  hypothetical protein  26.98 
 
 
391 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433382  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2955  hypothetical protein  27.07 
 
 
389 aa  52  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3267  hypothetical protein  23.46 
 
 
396 aa  52  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000221344  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0982  hypothetical protein  23.46 
 
 
396 aa  51.6  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.364369 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0133  hypothetical protein  24.72 
 
 
388 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.957824  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1009  hypothetical protein  28.7 
 
 
389 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000550438  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0185  hypothetical protein  26.06 
 
 
388 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0185376  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0179  hypothetical protein  27.27 
 
 
385 aa  45.1  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000153754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>