18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1212 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1212  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  424  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0781  hypothetical protein  69.61 
 
 
204 aa  301  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474074  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0918  hypothetical protein  69.61 
 
 
205 aa  295  3e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.254108 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2591  hypothetical protein  60.29 
 
 
204 aa  262  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2004  hypothetical protein  51.26 
 
 
204 aa  218  6e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3240  hypothetical protein  50.24 
 
 
209 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2130  hypothetical protein  33.66 
 
 
204 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222801  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0185  hypothetical protein  32.64 
 
 
388 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0185376  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3771  hypothetical protein  33.53 
 
 
389 aa  98.6  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000659386  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0133  hypothetical protein  33.68 
 
 
388 aa  98.2  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.957824  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4315  hypothetical protein  31.34 
 
 
391 aa  95.1  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433382  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3267  hypothetical protein  31.82 
 
 
396 aa  95.1  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000221344  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1009  hypothetical protein  33.66 
 
 
389 aa  92.4  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000550438  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0179  hypothetical protein  32.35 
 
 
385 aa  92.4  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000153754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0982  hypothetical protein  30.81 
 
 
396 aa  90.5  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.364369 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2955  hypothetical protein  33.33 
 
 
389 aa  87.8  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4757  hypothetical protein  24.73 
 
 
235 aa  52.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0253714  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1688  hypothetical protein  27.66 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>