170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2793 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  96.11 
 
 		 385 aa  766    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  100 
 
 		 386 aa  796    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  64.1 
 
 		 385 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  61.42 
 
 		 385 aa  488  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  63.03 
 
 		 386 aa  480  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  55.8 
 
 		 378 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  42.97 
 
 		 386 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  41.76 
 
 		 384 aa  280  4e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  39.1 
 
 		 387 aa  262  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  40.97 
 
 		 377 aa  262  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  40.97 
 
 		 377 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  39.23 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  39.19 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  38.56 
 
 		 410 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  39.32 
 
 		 394 aa  241  1e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  38.71 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  38.18 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2988  hypothetical protein  34.86 
 
 		 370 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  35.23 
 
 		 370 aa  209  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  32.16 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4113  hypothetical protein  33.71 
 
 		 370 aa  206  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4280  hypothetical protein  32.86 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2374  protein of unknown function DUF185  33.97 
 
 		 380 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4162  hypothetical protein  32.86 
 
 		 370 aa  202  9e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0783755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4484  hypothetical protein  32.86 
 
 		 368 aa  202  9e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.444169  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4001  hypothetical protein  33.05 
 
 		 370 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4011  hypothetical protein  33.05 
 
 		 370 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.188919  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0860  hypothetical protein  32.01 
 
 		 370 aa  200  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4374  hypothetical protein  31.16 
 
 		 370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  36.41 
 
 		 393 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  36.9 
 
 		 424 aa  196  8.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4393  hypothetical protein  32.29 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4340  hypothetical protein  32.29 
 
 		 368 aa  194  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  34.55 
 
 		 417 aa  190  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  33.24 
 
 		 370 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  34.27 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  37.01 
 
 		 397 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  33.15 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0199  protein of unknown function DUF185  30.77 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  36.52 
 
 		 384 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  34.39 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  36.68 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  34.26 
 
 		 386 aa  173  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  34.73 
 
 		 397 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4140  hypothetical protein  33.52 
 
 		 386 aa  172  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  33.78 
 
 		 391 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  32.55 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0301  protein of unknown function DUF185  35.99 
 
 		 375 aa  169  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0130  hypothetical protein  35.99 
 
 		 451 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  33.05 
 
 		 360 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4086  hypothetical protein  32.63 
 
 		 394 aa  159  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4224  hypothetical protein  34.79 
 
 		 376 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203293 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  32.04 
 
 		 397 aa  156  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0181  hypothetical protein  32.98 
 
 		 398 aa  156  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  33.06 
 
 		 395 aa  156  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1711  protein of unknown function DUF185  31.51 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.676361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  34.74 
 
 		 362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  31.27 
 
 		 396 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  34.89 
 
 		 366 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0224  hypothetical protein  33.07 
 
 		 400 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04309  hypothetical protein  31.7 
 
 		 394 aa  152  8.999999999999999e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954099  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  32.09 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  32.02 
 
 		 358 aa  151  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1049  hypothetical protein  30.27 
 
 		 392 aa  150  3e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0950573  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  29.66 
 
 		 398 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2524  hypothetical protein  32.05 
 
 		 403 aa  150  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0712  hypothetical protein  30.7 
 
 		 394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0801  hypothetical protein  30.39 
 
 		 394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  32.9 
 
 		 410 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000710511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  32.9 
 
 		 410 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  32.07 
 
 		 368 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  32.9 
 
 		 396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  32.9 
 
 		 396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  32.9 
 
 		 396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  32.9 
 
 		 396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  32.9 
 
 		 396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  31.07 
 
 		 396 aa  146  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  31.55 
 
 		 396 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  31.82 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2977  hypothetical protein  31.82 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2972  hypothetical protein  32.51 
 
 		 396 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1466  hypothetical protein  33.42 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1451  hypothetical protein  31.99 
 
 		 410 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  31.08 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1251  hypothetical protein  32.3 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6326  hypothetical protein  31.23 
 
 		 397 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  32.1 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  30.13 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3024  hypothetical protein  30.75 
 
 		 396 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3429  protein of unknown function DUF185  30.31 
 
 		 394 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192039 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  31.99 
 
 		 358 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  30.33 
 
 		 386 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  30.27 
 
 		 366 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  30.19 
 
 		 375 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0601  hypothetical protein  29.78 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.434393  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07361  hypothetical protein  26.84 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07341  hypothetical protein  27.06 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2759  protein of unknown function DUF185  30.19 
 
 		 366 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  29.92 
 
 		 356 aa  126  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0681  hypothetical protein  25.88 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.954033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>