More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1260 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
312 aa  626  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.89 
 
 
308 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  53.85 
 
 
301 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  51.84 
 
 
303 aa  296  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  51.51 
 
 
303 aa  295  7e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  51.51 
 
 
303 aa  295  9e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  51.51 
 
 
303 aa  295  9e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  51.51 
 
 
303 aa  295  9e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  51.51 
 
 
303 aa  294  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  51.17 
 
 
303 aa  294  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  51.17 
 
 
301 aa  294  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  51.51 
 
 
303 aa  292  4e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  50.84 
 
 
301 aa  287  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  44.95 
 
 
298 aa  208  7e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  43.05 
 
 
294 aa  196  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.49 
 
 
301 aa  196  5.000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  44.21 
 
 
319 aa  188  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  44.44 
 
 
286 aa  185  8e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  38.44 
 
 
302 aa  177  1e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  38.89 
 
 
296 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  37.62 
 
 
322 aa  172  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  38.81 
 
 
293 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.54 
 
 
302 aa  171  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.42 
 
 
283 aa  164  3e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  36.9 
 
 
294 aa  159  8e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  36.27 
 
 
299 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  39.36 
 
 
292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  35.88 
 
 
301 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  35.57 
 
 
307 aa  154  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.54 
 
 
343 aa  153  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.72 
 
 
302 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.02 
 
 
293 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  35 
 
 
295 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35 
 
 
295 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  35 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.35 
 
 
294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  34.14 
 
 
288 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  34.14 
 
 
288 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  32.3 
 
 
295 aa  142  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.27 
 
 
289 aa  142  8e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  35.19 
 
 
277 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  34.36 
 
 
306 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  33.22 
 
 
302 aa  139  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  33.22 
 
 
295 aa  139  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  31.72 
 
 
299 aa  135  9e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  32.87 
 
 
295 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  31.72 
 
 
312 aa  134  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.01 
 
 
315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.63 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1696  hypothetical protein  34 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  31.27 
 
 
307 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  31.27 
 
 
295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  31.97 
 
 
298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  31.86 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  29.24 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  33.78 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.8 
 
 
296 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0944  hypothetical protein  33.33 
 
 
279 aa  125  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  33.33 
 
 
308 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  30.74 
 
 
307 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  34.02 
 
 
293 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  30.16 
 
 
305 aa  124  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  31.08 
 
 
323 aa  122  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.92 
 
 
300 aa  122  6e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  31.38 
 
 
312 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.79 
 
 
252 aa  122  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00124524  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  29.73 
 
 
307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  31.23 
 
 
288 aa  120  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.38 
 
 
292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  31.58 
 
 
288 aa  119  7e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  31.47 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.01 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  33.1 
 
 
292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.08 
 
 
291 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.364061  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  30.5 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1796  permeases of the drug/metabolite transporter  32.88 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.463066  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  29.32 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  30.34 
 
 
311 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  30.84 
 
 
305 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  30.14 
 
 
316 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  30.14 
 
 
358 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  31.25 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  31.38 
 
 
303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  33.09 
 
 
288 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3301  hypothetical protein  29.04 
 
 
296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00885964  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1854  hypothetical protein  30.62 
 
 
316 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.135486 
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  30 
 
 
303 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  27.04 
 
 
336 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1470  hypothetical protein  29.51 
 
 
323 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.635983  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0290  hypothetical protein  30.21 
 
 
306 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0875  hypothetical protein  30.21 
 
 
306 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1667  hypothetical protein  30.21 
 
 
306 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2573  multidrug ABC transporter permease  30.21 
 
 
306 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2437  hypothetical protein  30.21 
 
 
306 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0322  hypothetical protein  30.21 
 
 
306 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698998  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.31 
 
 
308 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.65 
 
 
308 aa  106  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3674  hypothetical protein  29.73 
 
 
307 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.393093 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1325  integral membrane protein  32.96 
 
 
308 aa  106  5e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>