43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2773 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2773  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  661    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3346  protein of unknown function DUF114  29.79 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106769  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11070  periplasmic serine protease (ClpP class)  40.95 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000898783  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1781  hypothetical protein  35.81 
 
 		 276 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4091  hypothetical protein  28.04 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1139  hypothetical protein  39.42 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1334  protein of unknown function DUF114  38.14 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.611057  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1233  hypothetical protein  28.37 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.17311  normal  0.434623 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1020  hypothetical protein  40.21 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1661  hypothetical protein  40.21 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3727  hypothetical protein  28.76 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.175021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0202  protein of unknown function DUF114  27.94 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0926  hypothetical protein  40.21 
 
 		 274 aa  67  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03440  periplasmic serine protease (ClpP class)  40 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1198  hypothetical protein  36.36 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2297  protein of unknown function DUF114  30.16 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0011  hypothetical protein  40.2 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0011  hypothetical protein  40.2 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7800  hypothetical protein  29.95 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2712  protein of unknown function DUF114  26.05 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3319  hypothetical protein  41.03 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0215  protein of unknown function DUF114  37.5 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0321874  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1552  hypothetical protein  30.67 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238673 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4766  protein of unknown function DUF114  31.82 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0583634  hitchhiker  0.000468876 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0940  hypothetical protein  46.15 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0404  protein of unknown function DUF114  31.13 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0381  hypothetical protein  32.17 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.824542  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0678  hypothetical protein  38.14 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0335  hypothetical protein  32.14 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0491521  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3471  protein of unknown function DUF114  38.96 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3172  protein of unknown function DUF114  38.75 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.601853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1401  protein of unknown function DUF114  33.33 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.129163  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3527  protein of unknown function DUF114  36.19 
 
 		 275 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1874  hypothetical protein  37 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0558  protein of unknown function DUF114  30.94 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2943  hypothetical protein  40 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1537  hypothetical protein  39.13 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.675779  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3600  hypothetical protein  32.64 
 
 		 272 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.354038  normal  0.0141904 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4681  hypothetical protein  24.41 
 
 		 338 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3097  hypothetical protein  39.74 
 
 		 282 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2112  hypothetical protein  34.31 
 
 		 350 aa  52.8  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3424  protein of unknown function DUF114  31.87 
 
 		 339 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1299  protein of unknown function DUF114  30.32 
 
 		 277 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>