More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0489 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  100 
 
 		 509 aa  1023    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  76.18 
 
 		 509 aa  782    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  80.87 
 
 		 509 aa  852    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  61.86 
 
 		 510 aa  646    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  61.34 
 
 		 508 aa  647    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  58.98 
 
 		 513 aa  614  1e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  57.37 
 
 		 512 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  58.9 
 
 		 513 aa  590  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  55.38 
 
 		 508 aa  581  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  55.49 
 
 		 510 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  54.15 
 
 		 509 aa  584  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  54.21 
 
 		 512 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  53.82 
 
 		 512 aa  578  1e-164  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  57.11 
 
 		 509 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  56.58 
 
 		 511 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  54.49 
 
 		 513 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  54.53 
 
 		 511 aa  569  1e-161  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  54.78 
 
 		 506 aa  567  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  52.64 
 
 		 512 aa  568  1e-160  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  54.83 
 
 		 509 aa  568  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  54.24 
 
 		 509 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  52.64 
 
 		 512 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  54.04 
 
 		 509 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  52.54 
 
 		 513 aa  558  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  52.84 
 
 		 513 aa  555  1e-157  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  52.92 
 
 		 516 aa  557  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  51.47 
 
 		 511 aa  556  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  52.66 
 
 		 509 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  52.75 
 
 		 510 aa  549  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  51.08 
 
 		 512 aa  551  1e-155  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  51.66 
 
 		 514 aa  548  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  52.86 
 
 		 509 aa  548  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0337  Mg chelatase, subunit ChlI  73.73 
 
 		 390 aa  545  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.293156  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  53.36 
 
 		 520 aa  547  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  52.07 
 
 		 509 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0159  Mg chelatase, subunit ChlI  53.14 
 
 		 511 aa  543  1e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00157888  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  52.04 
 
 		 516 aa  540  9.999999999999999e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0672  Mg chelatase, subunit ChlI  52.42 
 
 		 518 aa  541  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  53.77 
 
 		 504 aa  538  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0558  Mg chelatase, subunit ChlI  52.22 
 
 		 518 aa  534  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  54.68 
 
 		 514 aa  530  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  52.29 
 
 		 506 aa  528  1e-149  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0605  Mg chelatase, subunit ChlI  52.22 
 
 		 518 aa  529  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  55.64 
 
 		 501 aa  529  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  50.78 
 
 		 512 aa  528  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  53.37 
 
 		 505 aa  525  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  52.75 
 
 		 512 aa  524  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1757  Mg chelatase-related protein  50.87 
 
 		 518 aa  520  1e-146  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2256  Mg chelatase, subunit ChlI  50.45 
 
 		 554 aa  520  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3079  Mg chelatase, subunit ChlI  53.8 
 
 		 512 aa  516  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0692369 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  54.44 
 
 		 505 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  51.59 
 
 		 506 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  50.89 
 
 		 507 aa  514  1e-144  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1391  Mg chelatase-related protein  51.28 
 
 		 512 aa  508  1e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000825184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  47.16 
 
 		 509 aa  509  1e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  50 
 
 		 508 aa  502  1e-141  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3688  Mg chelatase, subunit ChlI  52.77 
 
 		 504 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1529  Mg chelatase, subunit ChlI  48.32 
 
 		 506 aa  499  1e-140  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00744934  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3751  Mg chelatase, subunit ChlI  51.96 
 
 		 506 aa  498  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  51.49 
 
 		 496 aa  499  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1445  Mg chelatase-related protein  51.08 
 
 		 511 aa  497  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.555518  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0424  Mg chelatase, subunit ChlI  49.6 
 
 		 501 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0409  Mg chelatase, subunit ChlI  49.4 
 
 		 501 aa  491  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3733  Mg chelatase, subunit ChlI  49.7 
 
 		 507 aa  488  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.466129  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1022  Mg chelatase-related protein  50 
 
 		 509 aa  486  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  unclonable  0.00000000780236 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  52.78 
 
 		 504 aa  487  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0832  Mg chelatase, subunit ChlI  48.61 
 
 		 504 aa  486  1e-136  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3069  magnesium chelatase, ChlI subunit  86.46 
 
 		 308 aa  484  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0159361  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  52.85 
 
 		 485 aa  481  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  53.23 
 
 		 495 aa  481  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3748  Mg chelatase, subunit ChlI  50.1 
 
 		 505 aa  478  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.224013  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0788  Mg chelatase, subunit ChlI  51.05 
 
 		 511 aa  475  1e-133  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  49.4 
 
 		 499 aa  477  1e-133  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  48.12 
 
 		 498 aa  474  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0280  magnesium chelatase, ChlI subunit  73.53 
 
 		 309 aa  473  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  50.1 
 
 		 510 aa  474  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0194  Mg chelatase, subunit ChlI  51.27 
 
 		 510 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511798  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  45.76 
 
 		 507 aa  468  9.999999999999999e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4074  Mg chelatase, subunit ChlI  47.21 
 
 		 514 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3674  magnesium chelatase ChlI subunit  77.5 
 
 		 281 aa  463  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1377  Mg chelatase, subunit ChlI  45.77 
 
 		 519 aa  462  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000488427  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1135  Mg chelatase, subunit ChlI  48.53 
 
 		 505 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  49.8 
 
 		 497 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  48.9 
 
 		 497 aa  456  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  49.71 
 
 		 497 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0589  Mg chelatase, subunit ChlI  46.86 
 
 		 506 aa  456  1e-127  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2359  Mg chelatase, subunit ChlI  46.63 
 
 		 530 aa  457  1e-127  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  50.99 
 
 		 506 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0338  Mg(2+) chelatase family protein  48.93 
 
 		 510 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0216  Mg chelatase, subunit ChlI  47.68 
 
 		 517 aa  448  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3612  Mg chelatase, subunit ChlI  47.61 
 
 		 502 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623512  normal  0.505683 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0471  Mg chelatase-related protein  48.81 
 
 		 510 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0119  Mg chelatase, subunit ChlI  49.11 
 
 		 515 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.145359 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0288  Mg chelatase-related protein  48.06 
 
 		 513 aa  443  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0237  Mg chelatase-related protein  48.28 
 
 		 512 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0021  Mg chelatase-related protein  48.41 
 
 		 502 aa  442  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.253404  normal  0.0270376 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0782  Mg chelatase, subunit ChlI  46.95 
 
 		 510 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0231  Mg chelatase, subunit ChlI  47.53 
 
 		 517 aa  444  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1958  Mg chelatase-like protein  44.6 
 
 		 507 aa  438  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0810185  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1762  Mg chelatase, subunit ChlI  46.64 
 
 		 497 aa  440  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000904933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>