More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7274 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7274  nitroreductase  100 
 
 		 206 aa  401  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573924  normal  0.0842376 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0050  nitroreductase  73.2 
 
 		 208 aa  247  8e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01734  predicted oxidoreductase  41.72 
 
 		 183 aa  125  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00353733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1877  nitroreductase  41.72 
 
 		 183 aa  125  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380394  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1867  hypothetical protein  41.72 
 
 		 183 aa  125  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0147803  decreased coverage  0.00000404862 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1849  hypothetical protein  41.72 
 
 		 183 aa  125  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000672951  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1988  hypothetical protein  41.72 
 
 		 183 aa  125  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00470911  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2485  hypothetical protein  41.72 
 
 		 183 aa  125  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.297695 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01722  hypothetical protein  41.72 
 
 		 183 aa  125  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00796019  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2020  hypothetical protein  41.72 
 
 		 183 aa  124  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242439  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1480  nitroreductase  40.34 
 
 		 188 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0228393  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1426  hypothetical protein  41.72 
 
 		 183 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00297236  normal  0.808801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4012  nitroreductase  38.04 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147997  hitchhiker  0.000154736 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2050  hypothetical protein  41.1 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.658191  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1423  hypothetical protein  41.1 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.566409 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1407  hypothetical protein  41.1 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4506  nitroreductase  36.81 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1390  hypothetical protein  41.1 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3795  nitroreductase  38.04 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000177685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1405  nitroreductase  36.81 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000113316  normal  0.729658 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1802  nitroreductase family protein  39.77 
 
 		 186 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649607  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3592  nitroreductase  38.38 
 
 		 186 aa  118  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0449801  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1879  hypothetical protein  40.49 
 
 		 183 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000572902  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1682  hypothetical protein  41.21 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.5074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2674  nitroreductase  36.65 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0566  hypothetical protein  40.57 
 
 		 182 aa  112  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1919  hypothetical protein  37.93 
 
 		 186 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2721  hypothetical protein  38.04 
 
 		 183 aa  111  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6916  hitchhiker  0.00284611 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002916  protein ydjA  38.65 
 
 		 182 aa  111  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1828  nitroreductase  38.41 
 
 		 186 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22710  hypothetical protein  39.63 
 
 		 186 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1095  nitroreductase  35 
 
 		 219 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_004310  BR1069  nitroreductase family protein  36.99 
 
 		 194 aa  109  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600572  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3754  nitroreductase  42.77 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.951056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2747  nitroreductase  36.2 
 
 		 182 aa  108  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.501163 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2152  nitroreductase  36.42 
 
 		 195 aa  108  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2708  nitroreductase family protein  34.71 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2494  nitroreductase  33.91 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.838709  hitchhiker  0.00693244 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1665  nitroreductase  33.91 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1033  nitroreductase family protein  36.42 
 
 		 194 aa  105  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.680081  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1891  nitroreductase  35.58 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2374  nitroreductase  33.91 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.611093  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01930  nitroreductase  43.21 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2345  hypothetical protein  37.42 
 
 		 183 aa  105  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000126395  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2090  hypothetical protein  37.42 
 
 		 183 aa  104  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.363519  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1981  hypothetical protein  37.42 
 
 		 183 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959579  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1740  nitroreductase  35.06 
 
 		 182 aa  104  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1971  hypothetical protein  36.2 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1833  nitroreductase  35.58 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0967243  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2220  nitroreductase family protein  35.26 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.605376  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1354  nitroreductase  36.52 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000836569  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2304  nitroreductase  33.33 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0131618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2267  hypothetical protein  36.2 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1808  nitroreductase  32.76 
 
 		 182 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2478  nitroreductase  32.76 
 
 		 182 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15580  Nitroreductase  43.71 
 
 		 186 aa  101  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.978849  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1847  nitroreductase  32.76 
 
 		 182 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1495  hypothetical protein  36.53 
 
 		 187 aa  101  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0669321 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1800  nitroreductase  32.76 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.493936  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1967  hypothetical protein  34.97 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1011  nitroreductase  33.33 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01646  putative nitroreductase  34.97 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00644737  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1004  nitroreductase  33.94 
 
 		 191 aa  99.8  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.97914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1763  nitroreductase  36.21 
 
 		 190 aa  99  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4587  nitroreductase  41.14 
 
 		 228 aa  98.6  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7221  nitroreductase  38.65 
 
 		 221 aa  98.6  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2315  nitroreductase  33.14 
 
 		 182 aa  98.2  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2209  hypothetical protein  36.2 
 
 		 183 aa  97.8  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1617  nitroreductase  34.86 
 
 		 183 aa  97.8  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1287  aldehyde dehydrogenase  33.33 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0930  nitroreductase  35.67 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1532  nitroreductase  32.56 
 
 		 182 aa  95.9  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0266  nitroreductase  40 
 
 		 187 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0173  nitroreductase  35.22 
 
 		 191 aa  94.4  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000256246 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0909  nitroreductase family protein  32.93 
 
 		 184 aa  93.6  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.968398  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4233  nitroreductase  36.65 
 
 		 209 aa  92  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.064349  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02400  nitroreductase  36.65 
 
 		 191 aa  91.7  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305369  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03042  hypothetical protein  38.04 
 
 		 182 aa  91.7  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2590  nitroreductase family protein  29.03 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1635  nitroreductase  37.16 
 
 		 187 aa  89.4  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1457  nitroreductase family protein  33.14 
 
 		 182 aa  89  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2042  nitroreductase  30.3 
 
 		 194 aa  88.2  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1618  nitroreductase  34.95 
 
 		 195 aa  88.2  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6294  nitroreductase  35.93 
 
 		 187 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167962  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0775  nitroreductase family protein  35.15 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0450  nitroreductase  36.2 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1783  nitroreductase family protein  35.15 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2043  nitroreductase family protein  35.15 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.144976  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1291  nitroreductase  32.54 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1061  nitroreductase  32.75 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.425769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1068  nitroreductase family protein  35.15 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1800  nitroreductase  35.93 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2050  nitroreductase family protein  35.15 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1923  nitroreductase family protein  34.16 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3637  nitroreductase  37.18 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3888  nitroreductase  35.03 
 
 		 169 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0762  nitroreductase family protein  35.15 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0671  nitroreductase family protein  35.15 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2170  nitroreductase  36.05 
 
 		 204 aa  84.7  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3754  nitroreductase  39.74 
 
 		 220 aa  84.7  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.913341  normal  0.820114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>