298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6737 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6737  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  100 
 
 
509 aa  1022    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0291676  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3412  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  78.82 
 
 
353 aa  525  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.406116  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0088  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.04 
 
 
546 aa  302  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0719331 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0035  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.04 
 
 
546 aa  302  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3281  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.31 
 
 
518 aa  284  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0194889 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3262  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.31 
 
 
518 aa  283  7.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00994132 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4138  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.67 
 
 
511 aa  280  5e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.609635  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4192  IS6 family transposase  73.54 
 
 
198 aa  273  7e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4191  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  84.38 
 
 
229 aa  266  8.999999999999999e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8278  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.26 
 
 
545 aa  253  7e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7841  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.26 
 
 
545 aa  253  7e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8617  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.26 
 
 
545 aa  253  7e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2272  ISL3 family transposase  33.14 
 
 
539 aa  251  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00373654  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6189  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.53 
 
 
562 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.984628  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5033  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.56 
 
 
570 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.681228  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4953  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.26 
 
 
518 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12169  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6768  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.34 
 
 
501 aa  236  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.403374  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3814  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.56 
 
 
549 aa  232  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2991  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.61 
 
 
487 aa  229  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4601  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.61 
 
 
487 aa  229  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3101  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.61 
 
 
487 aa  229  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3974  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.28 
 
 
520 aa  224  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4193  transposase  83.2 
 
 
122 aa  208  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5451  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.71 
 
 
536 aa  197  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.268297 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3934  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  37.14 
 
 
399 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4809  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.59 
 
 
361 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0632  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.7 
 
 
378 aa  166  8e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3980  putative transposase  96.39 
 
 
83 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6734  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.79 
 
 
344 aa  163  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3056  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  26.03 
 
 
476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.905986  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1079  ISL3 family transposase  30.25 
 
 
327 aa  134  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.464356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4090  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.55 
 
 
441 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4192  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.75 
 
 
297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7029  hypothetical protein  66.35 
 
 
144 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4212  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  41.43 
 
 
284 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4643  hypothetical protein  40 
 
 
280 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7030  transposase  45.89 
 
 
153 aa  97.1  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465964  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1852  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.06 
 
 
176 aa  95.1  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.516656  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4223  insertion element IS466S transposase  51.52 
 
 
103 aa  95.1  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5414  hypothetical protein  31.96 
 
 
225 aa  88.6  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.678656 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3383  transposase  29.01 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3057  transposase  40 
 
 
89 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0736  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.7 
 
 
431 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843016  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3040  insertion element is466s transposase  35.03 
 
 
192 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3935  putative transposase  34.48 
 
 
118 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22250  transposase family protein  29.41 
 
 
457 aa  65.1  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20460  transposase  29.41 
 
 
407 aa  65.1  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0995165  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16150  transposase  29.41 
 
 
407 aa  65.1  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19680  transposase  29.41 
 
 
407 aa  65.1  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4119  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.74 
 
 
417 aa  62.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2538  integrase catalytic subunit  36.17 
 
 
424 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178355  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0631  transposase  30.7 
 
 
418 aa  62.4  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0849  transposase  31.62 
 
 
418 aa  62.4  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.414114  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1162  transposase  31.62 
 
 
418 aa  62.4  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1556  transposase  31.62 
 
 
418 aa  62.4  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1692  transposase  30.7 
 
 
442 aa  61.6  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.67531  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0368  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.58 
 
 
441 aa  61.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26440  transposase family protein  25.56 
 
 
428 aa  60.5  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0803  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.44 
 
 
396 aa  60.5  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05360  transposase family protein  25.56 
 
 
428 aa  60.5  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22120  transposase family protein  25.56 
 
 
428 aa  60.5  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.523931  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2371  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.52 
 
 
243 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1268  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.79 
 
 
390 aa  60.1  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2965  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.79 
 
 
390 aa  60.1  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1442  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.79 
 
 
390 aa  60.1  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3284  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.79 
 
 
390 aa  60.1  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3166  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.79 
 
 
390 aa  60.1  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4791  IstB ATP binding domain-containing protein  38.46 
 
 
284 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1264  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
336 aa  60.1  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0642781  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1792  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.21 
 
 
396 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.333719  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1367  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.21 
 
 
396 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00109866  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3098  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.21 
 
 
396 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0316374  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1438  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.06 
 
 
391 aa  58.9  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0333  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.77 
 
 
441 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2862  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.77 
 
 
441 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3176  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.77 
 
 
441 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1434  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.21 
 
 
396 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.458597  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06565  hypothetical protein  24.88 
 
 
397 aa  58.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2875  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  18.66 
 
 
391 aa  58.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0015  transposase  29.75 
 
 
299 aa  58.2  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2352  transposase ISL3 family protein  29.91 
 
 
440 aa  57.8  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1055  transposase  24.12 
 
 
296 aa  57.8  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9617  transposase  37.39 
 
 
230 aa  57.4  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.106287  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0138  transposase  23.77 
 
 
418 aa  57  0.0000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0918  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  21.95 
 
 
391 aa  57  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3856  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  21.95 
 
 
391 aa  57  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1940  transposase  24.12 
 
 
418 aa  56.2  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0399155  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1853  transposase  24.12 
 
 
418 aa  56.2  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0003  transposase  24.12 
 
 
418 aa  56.2  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3125  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.51 
 
 
396 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0463  transposase  24.12 
 
 
418 aa  56.2  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0505  transposase  24.12 
 
 
418 aa  56.2  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0560  transposase  24.12 
 
 
418 aa  56.2  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1543  transposase  24.12 
 
 
418 aa  56.2  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0952  ISRSO3-transposase ORFA protein  35.48 
 
 
354 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.273706  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04731  transposase TnpA, ISL3 family  24.65 
 
 
472 aa  55.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0781115  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3595  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.35 
 
 
378 aa  53.9  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104734  normal  0.17723 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3720  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  41.94 
 
 
186 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3978  transposase  32.32 
 
 
107 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.719199  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3384  hypothetical protein  40.68 
 
 
180 aa  53.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>