More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3595 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_25640  transposase family protein  83.82 
 
 
442 aa  647    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3595  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  100 
 
 
378 aa  759    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104734  normal  0.17723 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09110  transposase  81.48 
 
 
443 aa  623  1e-177  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0374233  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11890  transposase  81.48 
 
 
443 aa  623  1e-177  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.565159  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15140  transposase family protein  78.57 
 
 
451 aa  604  9.999999999999999e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0303728  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22840  transposase family protein  78.57 
 
 
438 aa  604  1.0000000000000001e-171  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.546721 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3311  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  76.46 
 
 
438 aa  593  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23600  transposase family protein  77.39 
 
 
438 aa  593  1e-168  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.237959  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1262  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  76.46 
 
 
438 aa  593  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25600  transposase family protein  77.39 
 
 
438 aa  593  1e-168  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23480  transposase family protein  74.07 
 
 
438 aa  573  1.0000000000000001e-162  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06980  transposase family protein  74.07 
 
 
438 aa  573  1.0000000000000001e-162  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18120  transposase family protein  81.27 
 
 
346 aa  566  1e-160  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0064535  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23830  transposase family protein  73.86 
 
 
450 aa  565  1e-160  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.955203 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04880  transposase family protein  72.94 
 
 
435 aa  566  1e-160  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06410  transposase family protein  72.94 
 
 
435 aa  566  1e-160  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21140  transposase family protein  73.86 
 
 
450 aa  565  1e-160  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25960  transposase family protein  71.47 
 
 
436 aa  545  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20360  transposase  70.74 
 
 
435 aa  544  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00530  transposase  70.74 
 
 
435 aa  544  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02160  transposase family protein  70.74 
 
 
435 aa  541  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.290407  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02150  transposase family protein  70.74 
 
 
435 aa  541  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24200  transposase family protein  70.74 
 
 
435 aa  541  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17110  transposase family protein  70.74 
 
 
435 aa  541  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21460  transposase family protein  70.74 
 
 
435 aa  541  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  unclonable  1.3054300000000002e-18  hitchhiker  0.0000742439 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06900  transposase family protein  65.52 
 
 
436 aa  504  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0445695  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22440  transposase family protein  65.52 
 
 
436 aa  504  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0283397  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22130  transposase family protein  67.13 
 
 
362 aa  498  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.900439  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22680  transposase family protein  73.4 
 
 
311 aa  466  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.971541  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0427  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  62.83 
 
 
433 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0439  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  62.83 
 
 
433 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.741864  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0776  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  62.83 
 
 
433 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.688226  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1169  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  62.83 
 
 
433 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0217925  normal  0.194588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1867  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  62.83 
 
 
433 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1877  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  62.83 
 
 
433 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.493303 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1941  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  62.83 
 
 
433 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.527296  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2168  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  62.83 
 
 
433 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00169456  hitchhiker  0.0053123 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2260  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  62.83 
 
 
433 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1027  normal  0.0456513 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3018  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  62.83 
 
 
433 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000260975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3079  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  62.83 
 
 
433 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.397889  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3429  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  62.83 
 
 
433 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213532  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4491  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  62.83 
 
 
433 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213532  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0040  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  50.53 
 
 
436 aa  347  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0738  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  50.53 
 
 
436 aa  347  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4581  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  50.53 
 
 
436 aa  347  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1433  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  46.83 
 
 
438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.207857 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22400  transposase family protein  41.81 
 
 
454 aa  227  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.323222  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05360  transposase family protein  41.81 
 
 
454 aa  227  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.711648  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23490  transposase family protein  41.81 
 
 
454 aa  227  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3047  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  40.43 
 
 
434 aa  210  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000291896  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1245  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  40.43 
 
 
434 aa  210  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139986  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2889  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  40.43 
 
 
434 aa  210  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0124927  hitchhiker  0.00109872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4632  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  40.43 
 
 
434 aa  210  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135033  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0990  transposase  55.56 
 
 
177 aa  149  7e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19680  transposase  30.31 
 
 
407 aa  117  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16150  transposase  30.31 
 
 
407 aa  117  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20460  transposase  30.31 
 
 
407 aa  117  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0995165  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22250  transposase family protein  30.31 
 
 
457 aa  117  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05360  transposase family protein  30.69 
 
 
428 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22120  transposase family protein  30.18 
 
 
428 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.523931  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26440  transposase family protein  30.18 
 
 
428 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0646  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.52 
 
 
408 aa  96.7  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.468712  normal  0.0451791 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1542  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.33 
 
 
408 aa  94  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1174  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.33 
 
 
408 aa  94  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000815795  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2002  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.33 
 
 
408 aa  94  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1002  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.33 
 
 
408 aa  94  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.520122  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0551  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.33 
 
 
408 aa  94  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.340213  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0599  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.33 
 
 
408 aa  94  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0373  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.59 
 
 
408 aa  94  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384224  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1177  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.33 
 
 
408 aa  94  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123826  normal  0.601968 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4473  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.21 
 
 
439 aa  90.5  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0461  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.21 
 
 
439 aa  90.5  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0542  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.21 
 
 
439 aa  90.5  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1765  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.21 
 
 
439 aa  90.5  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00126506  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1966  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.21 
 
 
439 aa  90.5  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415277  normal  0.0178041 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2910  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.21 
 
 
439 aa  90.5  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000150171  hitchhiker  0.0000194691 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2871  transposase  27.78 
 
 
422 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0586611  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0906  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.56 
 
 
440 aa  87.8  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0617  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.56 
 
 
440 aa  87.8  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4069  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.56 
 
 
442 aa  86.7  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.414136 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0341  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.8 
 
 
408 aa  86.3  9e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.717183  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04731  transposase TnpA, ISL3 family  28.27 
 
 
472 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0781115  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1035  hypothetical protein  24.32 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2037  hypothetical protein  24.32 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2311  hypothetical protein  24.32 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2402  hypothetical protein  24.32 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12824  transposase  54.55 
 
 
132 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000191598  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0556  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.27 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2780  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.27 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.728201  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0010  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.27 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4792  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  23.39 
 
 
407 aa  80.5  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0196  hypothetical protein  27.17 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2732  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  23.39 
 
 
407 aa  80.5  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4575  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  23.39 
 
 
407 aa  80.5  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3732  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  30.14 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5329  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  23.39 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1514  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.74 
 
 
459 aa  80.1  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.623533 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1755  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  23.3 
 
 
391 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0966  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.72 
 
 
406 aa  79.3  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0650816  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0228  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  22.98 
 
 
402 aa  79  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>