More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23480 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_22840  transposase family protein  76.03 
 
 
438 aa  678    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.546721 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25600  transposase family protein  84.47 
 
 
438 aa  745    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23830  transposase family protein  73.35 
 
 
450 aa  634    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.955203 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21460  transposase family protein  72.48 
 
 
435 aa  642    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  unclonable  1.3054300000000002e-18  hitchhiker  0.0000742439 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06980  transposase family protein  99.54 
 
 
438 aa  871    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3311  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  73.52 
 
 
438 aa  661    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09110  transposase  74.36 
 
 
443 aa  651    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0374233  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02160  transposase family protein  72.48 
 
 
435 aa  642    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.290407  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02150  transposase family protein  72.48 
 
 
435 aa  642    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23480  transposase family protein  100 
 
 
438 aa  874    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21140  transposase family protein  73.35 
 
 
450 aa  634    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04880  transposase family protein  71.17 
 
 
435 aa  634    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15140  transposase family protein  76.73 
 
 
451 aa  679    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0303728  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00530  transposase  72.25 
 
 
435 aa  643    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1262  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  73.52 
 
 
438 aa  661    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24200  transposase family protein  72.48 
 
 
435 aa  642    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20360  transposase  72.25 
 
 
435 aa  643    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11890  transposase  74.36 
 
 
443 aa  651    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.565159  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17110  transposase family protein  72.48 
 
 
435 aa  642    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23600  transposase family protein  84.47 
 
 
438 aa  745    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.237959  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06410  transposase family protein  71.17 
 
 
435 aa  634    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25640  transposase family protein  75.23 
 
 
442 aa  660    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25960  transposase family protein  70.02 
 
 
436 aa  624  1e-177  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06900  transposase family protein  64.07 
 
 
436 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0445695  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3595  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  74.07 
 
 
378 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104734  normal  0.17723 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22440  transposase family protein  64.07 
 
 
436 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0283397  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18120  transposase family protein  76.88 
 
 
346 aa  543  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0064535  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3079  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  58.94 
 
 
433 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.397889  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3018  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  58.94 
 
 
433 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000260975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1877  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  58.94 
 
 
433 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.493303 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1941  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  58.94 
 
 
433 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.527296  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0439  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  58.94 
 
 
433 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.741864  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1169  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  58.94 
 
 
433 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0217925  normal  0.194588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1867  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  58.94 
 
 
433 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0776  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  58.94 
 
 
433 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.688226  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0427  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  58.94 
 
 
433 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2260  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  58.94 
 
 
433 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1027  normal  0.0456513 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2168  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  58.94 
 
 
433 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00169456  hitchhiker  0.0053123 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4491  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  58.94 
 
 
433 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213532  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3429  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  58.94 
 
 
433 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213532  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22130  transposase family protein  67.5 
 
 
362 aa  499  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.900439  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22680  transposase family protein  72.99 
 
 
311 aa  475  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.971541  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0040  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  48.72 
 
 
436 aa  377  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0738  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  48.72 
 
 
436 aa  377  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4581  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  48.72 
 
 
436 aa  377  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1433  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  46.96 
 
 
438 aa  372  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.207857 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23490  transposase family protein  39.95 
 
 
454 aa  245  9e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22400  transposase family protein  39.95 
 
 
454 aa  245  9e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.323222  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05360  transposase family protein  39.95 
 
 
454 aa  245  9e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.711648  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3047  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.79 
 
 
434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000291896  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4632  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.79 
 
 
434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135033  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1245  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.79 
 
 
434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139986  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2889  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.79 
 
 
434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0124927  hitchhiker  0.00109872 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0990  transposase  49.7 
 
 
177 aa  144  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22250  transposase family protein  29.45 
 
 
457 aa  119  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16150  transposase  29.1 
 
 
407 aa  117  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20460  transposase  29.1 
 
 
407 aa  117  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0995165  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19680  transposase  29.1 
 
 
407 aa  117  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26440  transposase family protein  28.65 
 
 
428 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22120  transposase family protein  28.65 
 
 
428 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.523931  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1966  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.06 
 
 
439 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415277  normal  0.0178041 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0461  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.06 
 
 
439 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4473  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.06 
 
 
439 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1765  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.06 
 
 
439 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00126506  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0542  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.06 
 
 
439 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2910  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.06 
 
 
439 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000150171  hitchhiker  0.0000194691 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05360  transposase family protein  28.37 
 
 
428 aa  100  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0617  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.8 
 
 
440 aa  100  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0906  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.8 
 
 
440 aa  100  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4069  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.8 
 
 
442 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.414136 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0966  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.66 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0650816  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1035  hypothetical protein  24.07 
 
 
391 aa  94  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2037  hypothetical protein  24.07 
 
 
391 aa  94  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2311  hypothetical protein  24.07 
 
 
391 aa  94  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2402  hypothetical protein  24.07 
 
 
391 aa  94  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0646  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.49 
 
 
408 aa  93.6  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.468712  normal  0.0451791 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0551  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.49 
 
 
408 aa  93.6  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.340213  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1177  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.49 
 
 
408 aa  93.6  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123826  normal  0.601968 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1542  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.49 
 
 
408 aa  93.6  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1002  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.49 
 
 
408 aa  93.6  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.520122  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2002  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.49 
 
 
408 aa  93.6  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1174  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.49 
 
 
408 aa  93.2  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000815795  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0599  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.49 
 
 
408 aa  93.2  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0373  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.81 
 
 
408 aa  92  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384224  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2871  transposase  24.53 
 
 
422 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0586611  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4457  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.73 
 
 
422 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0341  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.62 
 
 
408 aa  89  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.717183  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0197  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.64 
 
 
429 aa  86.3  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12824  transposase  56.52 
 
 
132 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000191598  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0473  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.64 
 
 
429 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3732  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  32.09 
 
 
251 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1106  transposase TnpA  25.64 
 
 
429 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1124  transposase TnpA  25.64 
 
 
429 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2905  transposase TnpA  25.64 
 
 
429 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0553555  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1607  transposase TnpA  25.64 
 
 
429 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.694754  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2909  transposase TnpA  25.64 
 
 
429 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0389  transposase TnpA  25.64 
 
 
429 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.241503  normal  0.900463 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0885  transposase TnpA  25.64 
 
 
429 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2328  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.64 
 
 
429 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0888  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.64 
 
 
429 aa  85.9  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>