More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_05360 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_23490  transposase family protein  100 
 
 
454 aa  922    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22400  transposase family protein  100 
 
 
454 aa  922    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.323222  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05360  transposase family protein  100 
 
 
454 aa  922    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.711648  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2889  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.27 
 
 
434 aa  288  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0124927  hitchhiker  0.00109872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4632  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.27 
 
 
434 aa  288  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135033  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1245  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.27 
 
 
434 aa  288  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139986  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3047  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.27 
 
 
434 aa  288  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000291896  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0738  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  40.05 
 
 
436 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0040  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  40.05 
 
 
436 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4581  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  40.05 
 
 
436 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1262  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.03 
 
 
438 aa  260  4e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3311  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.03 
 
 
438 aa  260  4e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25600  transposase family protein  38.93 
 
 
438 aa  257  3e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23600  transposase family protein  38.93 
 
 
438 aa  257  3e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.237959  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22130  transposase family protein  42.98 
 
 
362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.900439  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25960  transposase family protein  38.85 
 
 
436 aa  254  3e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06980  transposase family protein  40.19 
 
 
438 aa  254  3e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23480  transposase family protein  39.95 
 
 
438 aa  251  2e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09110  transposase  39.42 
 
 
443 aa  244  3e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0374233  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20360  transposase  37.32 
 
 
435 aa  244  3e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02160  transposase family protein  37.56 
 
 
435 aa  244  3e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.290407  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02150  transposase family protein  37.56 
 
 
435 aa  244  3e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24200  transposase family protein  37.56 
 
 
435 aa  244  3e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21460  transposase family protein  37.56 
 
 
435 aa  244  3e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  unclonable  1.3054300000000002e-18  hitchhiker  0.0000742439 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00530  transposase  37.32 
 
 
435 aa  244  3e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11890  transposase  39.42 
 
 
443 aa  244  3e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.565159  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17110  transposase family protein  37.56 
 
 
435 aa  244  3e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06900  transposase family protein  37.27 
 
 
436 aa  242  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0445695  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22440  transposase family protein  37.27 
 
 
436 aa  242  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0283397  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22840  transposase family protein  37.19 
 
 
438 aa  240  4e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.546721 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04880  transposase family protein  38.57 
 
 
435 aa  239  5.999999999999999e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06410  transposase family protein  38.57 
 
 
435 aa  239  5.999999999999999e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1433  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.13 
 
 
438 aa  239  8e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.207857 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15140  transposase family protein  36.97 
 
 
451 aa  239  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0303728  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18120  transposase family protein  42.53 
 
 
346 aa  238  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0064535  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25640  transposase family protein  38.78 
 
 
442 aa  237  4e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21140  transposase family protein  37.15 
 
 
450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23830  transposase family protein  37.15 
 
 
450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.955203 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3429  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.43 
 
 
433 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213532  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4491  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.43 
 
 
433 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213532  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3079  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.43 
 
 
433 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.397889  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3018  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.43 
 
 
433 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000260975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2260  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.43 
 
 
433 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1027  normal  0.0456513 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0427  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.43 
 
 
433 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0439  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.43 
 
 
433 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.741864  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0776  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.43 
 
 
433 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.688226  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1169  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.43 
 
 
433 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0217925  normal  0.194588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1867  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.43 
 
 
433 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1877  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.43 
 
 
433 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.493303 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1941  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.43 
 
 
433 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.527296  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2168  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.43 
 
 
433 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00169456  hitchhiker  0.0053123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3595  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  40.32 
 
 
378 aa  228  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104734  normal  0.17723 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22680  transposase family protein  43.28 
 
 
311 aa  221  3e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.971541  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26440  transposase family protein  32.79 
 
 
428 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22120  transposase family protein  32.79 
 
 
428 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.523931  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05360  transposase family protein  32.4 
 
 
428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20460  transposase  28.97 
 
 
407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0995165  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19680  transposase  28.97 
 
 
407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16150  transposase  28.97 
 
 
407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22250  transposase family protein  29.07 
 
 
457 aa  132  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0617  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.86 
 
 
440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0906  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.86 
 
 
440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4069  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.86 
 
 
442 aa  110  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.414136 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1966  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.79 
 
 
439 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415277  normal  0.0178041 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4473  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.79 
 
 
439 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2910  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.79 
 
 
439 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000150171  hitchhiker  0.0000194691 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0542  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.79 
 
 
439 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0461  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.79 
 
 
439 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1765  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.79 
 
 
439 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00126506  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3509  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.76 
 
 
408 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1816  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.76 
 
 
408 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4482  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.59 
 
 
408 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4034  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.76 
 
 
408 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04731  transposase TnpA, ISL3 family  25.18 
 
 
472 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0781115  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0866  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.36 
 
 
434 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2977  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.11 
 
 
408 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0966  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.21 
 
 
406 aa  100  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0650816  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3732  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  32.56 
 
 
251 aa  100  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0803  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.97 
 
 
396 aa  97.8  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3125  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  23.21 
 
 
396 aa  96.7  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0197  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.88 
 
 
429 aa  96.7  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2328  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.88 
 
 
429 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1106  transposase TnpA  24.88 
 
 
429 aa  96.3  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1124  transposase TnpA  24.88 
 
 
429 aa  96.3  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2905  transposase TnpA  24.88 
 
 
429 aa  96.3  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0553555  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1607  transposase TnpA  24.88 
 
 
429 aa  96.3  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.694754  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2909  transposase TnpA  24.88 
 
 
429 aa  96.3  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0389  transposase TnpA  24.88 
 
 
429 aa  96.3  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.241503  normal  0.900463 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0885  transposase TnpA  24.88 
 
 
429 aa  96.3  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0888  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.88 
 
 
429 aa  95.9  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1792  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.92 
 
 
396 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.333719  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1434  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.92 
 
 
396 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.458597  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2871  transposase  24.07 
 
 
422 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0586611  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3098  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.92 
 
 
396 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0316374  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0473  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.88 
 
 
429 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1367  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.92 
 
 
396 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00109866  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0556  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.91 
 
 
420 aa  94.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2780  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.91 
 
 
420 aa  94.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.728201  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0196  hypothetical protein  27.61 
 
 
277 aa  94.4  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4457  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.84 
 
 
422 aa  94.4  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>