More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0736 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0736  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  100 
 
 
431 aa  881    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843016  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0368  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  68.76 
 
 
441 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2352  transposase ISL3 family protein  67.75 
 
 
440 aa  598  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3176  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  67.29 
 
 
441 aa  587  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0333  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  67.29 
 
 
441 aa  587  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2862  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  67.29 
 
 
441 aa  587  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4119  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  51.19 
 
 
417 aa  436  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0116  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  51.67 
 
 
421 aa  431  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2101  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  52.35 
 
 
413 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.135516  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1429  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  52.35 
 
 
413 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.34771 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2462  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  40.05 
 
 
411 aa  305  7e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2612  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.62 
 
 
413 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0697  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.62 
 
 
413 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0158172  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0254  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.05 
 
 
406 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151217  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0652  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.05 
 
 
406 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0716  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.05 
 
 
406 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0872  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.05 
 
 
406 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1079  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.05 
 
 
406 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1664  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.05 
 
 
406 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2270  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.05 
 
 
406 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2284  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.14 
 
 
413 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1380  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.14 
 
 
413 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0319  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.14 
 
 
413 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1538  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.14 
 
 
413 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2266  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.14 
 
 
413 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2326  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.14 
 
 
413 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00136305  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4134  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.14 
 
 
413 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00235401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3181  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.14 
 
 
413 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4115  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.14 
 
 
413 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2396  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.14 
 
 
413 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0107  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.14 
 
 
413 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0561  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.9 
 
 
413 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2879  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.9 
 
 
413 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.132844  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0708  transposase  35.87 
 
 
411 aa  273  6e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0788  transposase  35.87 
 
 
411 aa  273  6e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0086  transposase  35.87 
 
 
411 aa  272  7e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0202  transposase  35.87 
 
 
411 aa  272  7e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0597  transposase  35.87 
 
 
411 aa  272  7e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.600179  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0765  transposase  35.87 
 
 
411 aa  272  7e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0832  transposase  35.87 
 
 
411 aa  272  7e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.108641  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1063  transposase  35.87 
 
 
411 aa  272  7e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1507  transposase  35.87 
 
 
411 aa  272  7e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.667036  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1918  transposase  35.87 
 
 
411 aa  272  7e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1981  transposase  35.87 
 
 
411 aa  272  7e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2939  transposase  35.16 
 
 
371 aa  271  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00230958  normal  0.013078 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0658  transposase  35.87 
 
 
411 aa  270  4e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.712322  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0748  transposase  35.87 
 
 
411 aa  270  4e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0642968  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1580  transposase  35.87 
 
 
411 aa  270  4e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000196779  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7486  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.49 
 
 
407 aa  249  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0228  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  31.1 
 
 
402 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0665  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  31.1 
 
 
402 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.180609  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04311  ISXoo13 transposase  35.53 
 
 
411 aa  231  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05742  ISXoo13 transposase  35.29 
 
 
411 aa  230  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02212  ISXoo13 transposase  35.29 
 
 
411 aa  230  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.359732  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01375  ISXoo13 transposase  35.29 
 
 
411 aa  230  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04079  ISXoo13 transposase  35.29 
 
 
411 aa  230  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.208435  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01111  ISXoo13 transposase  35.29 
 
 
411 aa  229  6e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01504  ISXoo13 transposase  35.29 
 
 
411 aa  229  8e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04734  ISXoo13 transposase  35.29 
 
 
411 aa  229  8e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232641  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04847  ISXoo13 transposase  35.29 
 
 
411 aa  229  8e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01568  ISXoo13 transposase  35.06 
 
 
411 aa  229  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05630  ISXoo13 transposase  35.06 
 
 
411 aa  228  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.699256  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06103  ISXoo13 transposase  35.06 
 
 
411 aa  228  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.600961  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01758  ISXoo13 transposase  35.06 
 
 
411 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.339943  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02426  ISXoo13 transposase  35.06 
 
 
411 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.814284  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02978  ISXoo13 transposase  35.06 
 
 
411 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02786  ISXoo13 transposase  35.06 
 
 
411 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04142  ISXoo13 transposase  34.82 
 
 
411 aa  226  7e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1867  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.29 
 
 
408 aa  223  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.90501  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2200  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.29 
 
 
408 aa  223  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.240905  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2148  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.29 
 
 
408 aa  223  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.493226  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1226  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.29 
 
 
408 aa  223  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1116  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.29 
 
 
408 aa  223  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.495823 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3253  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.65 
 
 
417 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0115  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.65 
 
 
417 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0487  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.65 
 
 
417 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2342  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.65 
 
 
417 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712759  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2456  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.65 
 
 
417 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.352628  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3487  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.65 
 
 
417 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0797  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.41 
 
 
417 aa  219  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1788  transposase and inactivated derivatives  33.65 
 
 
411 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0526  putative transposase  32.46 
 
 
406 aa  201  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0062  hypothetical protein  49.52 
 
 
213 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0299  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.35 
 
 
408 aa  191  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.812028  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03122  transposase  37 
 
 
322 aa  187  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00450  transposase  31.24 
 
 
420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03140  transposase  31.24 
 
 
420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10230  transposase  31.24 
 
 
420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04880  transposase  31.24 
 
 
420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14300  transposase  31.24 
 
 
420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.381187  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04670  transposase  31.24 
 
 
420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0010  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.48 
 
 
420 aa  173  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2780  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.09 
 
 
420 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.728201  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0556  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.09 
 
 
420 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8543  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.15 
 
 
425 aa  166  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  hitchhiker  0.0000144931 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14350  transposase  32.68 
 
 
350 aa  162  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1444  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.21 
 
 
407 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.551686  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0936  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.56 
 
 
411 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1433  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.15 
 
 
411 aa  160  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0006  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.56 
 
 
411 aa  160  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>