93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3040 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3040  insertion element is466s transposase  100 
 
 		 192 aa  383  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4138  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  59.65 
 
 		 511 aa  201  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.609635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4643  hypothetical protein  66.14 
 
 		 280 aa  157  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4223  insertion element IS466S transposase  63.64 
 
 		 103 aa  91.3  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6737  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.99 
 
 		 509 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0291676  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3412  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.81 
 
 		 353 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.406116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0088  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.98 
 
 		 546 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0719331 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0035  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.98 
 
 		 546 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4601  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.41 
 
 		 487 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3101  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.41 
 
 		 487 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2991  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.41 
 
 		 487 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8617  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.41 
 
 		 545 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8278  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.41 
 
 		 545 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7841  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.41 
 
 		 545 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2909  ISGsu6, transposase OrfA  35.44 
 
 		 342 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.29922  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3407  ISGsu6, transposase OrfA  35.44 
 
 		 342 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36480  transposase, helix-turn-helix, Fis-type  36.27 
 
 		 341 aa  45.1  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49630  helix-turn-helix, Fis-type  36.27 
 
 		 341 aa  45.1  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.840005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31560  Transposase  37.78 
 
 		 341 aa  44.7  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0036  transposase  38.16 
 
 		 491 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1183  transposase  38.16 
 
 		 489 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138357 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1238  transposase  38.16 
 
 		 491 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126413 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0098  IS21 family transposase  38.16 
 
 		 491 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.2973499999999993e-20  hitchhiker  2.05788e-63 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1305  transposase  38.16 
 
 		 491 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1441  transposase  38.16 
 
 		 491 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1628  transposase  38.16 
 
 		 491 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1939  transposase  38.16 
 
 		 491 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0012517  normal  0.673499 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2877  transposase  38.16 
 
 		 491 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3336  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 491 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3393  transposase  38.16 
 
 		 491 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.39722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3532  transposase  38.16 
 
 		 491 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.0612525 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4054  transposase  38.16 
 
 		 491 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0048  IS100 transposase orfA  39.47 
 
 		 340 aa  44.3  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09530  integrase  37.78 
 
 		 341 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3154  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2088  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.207066 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2155  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0564082  normal  0.0481856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2171  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0335942 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2392  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.392902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2527  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2586  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00244507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2677  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.585168  normal  0.0366075 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2797  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000133045  normal  0.199341 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2905  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00121621  normal  0.994964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2960  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154243 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0015  IS21 family transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3216  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000564447  normal  0.0522706 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3280  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0112823 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3444  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3487  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.169046 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3634  putative transposase  38.16 
 
 		 338 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3672  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3800  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3951  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4125  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44357  normal  0.500657 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0029  IS21 family transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0448  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.453908  hitchhiker  0.00000287146 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0530  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000118737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0314  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.415268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0136  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0217084 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0634  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0933756  normal  0.145557 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0689  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0888  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0176798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1049  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0362189  normal  0.0286616 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0077  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3338  IS100, transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1294  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0001  IS21 family transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122483 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1904  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789725 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2025  insertion sequence transposase  38.16 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3013  ISPsy4, transposase  32.18 
 
 		 340 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0378398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2740  ISPsy4, transposase  32.18 
 
 		 340 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0055  ISPsy4, transposase  32.18 
 
 		 340 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2387  ISPsy4, transposase  32.18 
 
 		 340 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010584  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2321  ISPsy4, transposase  32.18 
 
 		 340 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000712156  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1659  ISPsy4, transposase  32.18 
 
 		 340 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1095  ISPsy4, transposase  32.18 
 
 		 340 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189576  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0194  ISPsy4, transposase  32.18 
 
 		 340 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0292  ISPsy4, transposase  32.18 
 
 		 340 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0833  ISPsy4, transposase  32.18 
 
 		 340 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0865  ISPsy4, transposase  32.18 
 
 		 340 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3224  ISPsy4, transposase  32.18 
 
 		 340 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.038075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3433  ISPsy4, transposase  32.18 
 
 		 340 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.45779  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3608  ISPsy4, transposase  32.18 
 
 		 340 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4013  ISPsy4, transposase  32.18 
 
 		 340 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4269  ISPsy4, transposase  32.18 
 
 		 340 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4625  ISPsy4, transposase  32.18 
 
 		 340 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146787  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4730  ISPsy4, transposase  32.18 
 
 		 340 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4769  ISPsy4, transposase  32.18 
 
 		 340 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5575  ISPsy4, transposase  32.18 
 
 		 340 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0040  ISPsy4, transposase  32.18 
 
 		 340 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.348986  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0013  ISPsy4, transposase  32.18 
 
 		 340 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0019  ISPsy4, transposase  32.18 
 
 		 340 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>