46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4109 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4109  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  278  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3722  hypothetical protein  37.59 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7153  hypothetical protein  35.29 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0228295  decreased coverage  0.00640549 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  31.33 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6762  hypothetical protein  28.99 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  31.71 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4750  hypothetical protein  31.85 
 
 		 181 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.881143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  27.69 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  31.34 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5153  hypothetical protein  34.11 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  31.51 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3526  hypothetical protein  33.09 
 
 		 178 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5242  hypothetical protein  34.11 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.766001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  33.59 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5534  hypothetical protein  34.11 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0753  hypothetical protein  30.41 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  30.95 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  29.69 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  29.84 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  32.54 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  31.97 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2721  hypothetical protein  31.15 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1179  hypothetical protein  28.47 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  28.89 
 
 		 190 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  32.09 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  32.2 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1152  hypothetical protein  27.74 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1169  hypothetical protein  27.74 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2722  hypothetical protein  31.67 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  30 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4369  hypothetical protein  30.53 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0973  carotenoid binding protein  28.33 
 
 		 318 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.200423  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  29.03 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  29.37 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  29.03 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2149  enzyme  40.91 
 
 		 208 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0432  hypothetical protein  30.16 
 
 		 159 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0608  hypothetical protein  28.35 
 
 		 318 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13509  hypothetical protein  30.91 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  29.29 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2029  hypothetical protein  34.88 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0292  hypothetical protein  36.07 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3464  hypothetical protein  36.59 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  27.74 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  27.74 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  30.5 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>