71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0174 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0174  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  381  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4399  hypothetical protein  61.67 
 
 		 182 aa  216  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.722704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  31.79 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  37.23 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  34.36 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  30.95 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1625  hypothetical protein  32.88 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  31.85 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  31.47 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  31.65 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  33.99 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2162  hypothetical protein  30.43 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5079  protein of unknown function DUF820  26.74 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.581399 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  31.9 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  31.18 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  27.94 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  30.36 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1143  hypothetical protein  32.12 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  31.88 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  27.41 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  33.96 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  28.12 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  26.52 
 
 		 187 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7645  protein of unknown function DUF820  27.69 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  28.91 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  30.19 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  29.69 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  28.26 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3259  protein of unknown function DUF820  31.82 
 
 		 242 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00168542  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  31.13 
 
 		 185 aa  48.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2097  protein of unknown function DUF820  29.41 
 
 		 191 aa  48.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  26.11 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  24.29 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1389  protein of unknown function DUF820  27.78 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2963  protein of unknown function DUF820  30.71 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  36.49 
 
 		 242 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  27.34 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5162  protein of unknown function DUF820  25.93 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688215 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  27.33 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  26.15 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  42.31 
 
 		 180 aa  45.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3415  protein of unknown function DUF820  31.93 
 
 		 186 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2598  protein of unknown function DUF820  22.42 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000930706  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5110  protein of unknown function DUF820  25.18 
 
 		 145 aa  45.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10814  normal  0.277047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1720  protein of unknown function DUF820  32 
 
 		 210 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00000927877  decreased coverage  0.000371214 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0217  hypothetical protein  31.71 
 
 		 186 aa  44.7  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2224  hypothetical protein  28.03 
 
 		 219 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  30.87 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  32.98 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1423  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4530  hypothetical protein  27.54 
 
 		 162 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  29.29 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  30.94 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3352  hypothetical protein  27.36 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0400145  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  25 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1503  hypothetical protein  21.62 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000135867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  21.32 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  26.67 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3996  hypothetical protein  32.85 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3548  hypothetical protein  34.62 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5899  hypothetical protein  27.33 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  29.55 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  29.59 
 
 		 241 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  22.14 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0075  protein of unknown function DUF820  27.74 
 
 		 184 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928941 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  21.58 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4570  protein of unknown function DUF820  31.93 
 
 		 198 aa  41.6  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.432927  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 		 251 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0601  protein of unknown function DUF820  34.34 
 
 		 222 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2157  protein of unknown function DUF820  31.78 
 
 		 185 aa  41.2  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  23.31 
 
 		 187 aa  41.2  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>