More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3502 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7067  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  47.5 
 
 		 881 aa  640    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3299  CoA-binding domain protein  45.43 
 
 		 976 aa  640    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1469  CoA-binding domain protein  47.25 
 
 		 902 aa  648    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3502  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 872 aa  1697    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667038  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1240  GCN5-related N-acetyltransferase  67.18 
 
 		 920 aa  1084    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0677298  hitchhiker  0.00305841 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  47.31 
 
 		 926 aa  682    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2128  hypothetical protein  45.61 
 
 		 907 aa  633  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505771  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2384  CoA-binding domain-containing protein  46.2 
 
 		 887 aa  629  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.272058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3564  CoA-binding domain protein  47.76 
 
 		 902 aa  629  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695831  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3787  GCN5-related N-acetyltransferase  46.33 
 
 		 893 aa  615  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.152255  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1628  GCN5-related N-acetyltransferase  43.68 
 
 		 901 aa  613  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2237  CoA-binding domain protein  42.54 
 
 		 950 aa  601  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0315579  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2948  CoA-binding domain-containing protein  43.35 
 
 		 899 aa  597  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.574552  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1622  CoA-binding domain protein  42.11 
 
 		 894 aa  584  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000156668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  46.02 
 
 		 868 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277001  normal  0.28701 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1548  CoA-binding domain protein  45.14 
 
 		 899 aa  560  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25767  normal  0.134976 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1833  CoA-binding domain protein  41.71 
 
 		 903 aa  562  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.415665  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13180  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  41.18 
 
 		 909 aa  531  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.135541  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1628  CoA-binding domain protein  50 
 
 		 821 aa  529  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00866172  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1929  GCN5-related protein N-acetyltransferase  43.09 
 
 		 907 aa  528  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.191743 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1423  CoA-binding domain-containing protein  44.94 
 
 		 909 aa  524  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.382585  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  39.48 
 
 		 883 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16050  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  40.97 
 
 		 934 aa  501  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.243356 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1416  GCN5-related N-acetyltransferase  37.65 
 
 		 909 aa  472  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.953678  normal  0.831405 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1932  GCN5-related N-acetyltransferase  41.32 
 
 		 907 aa  466  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.56977  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14440  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  38.12 
 
 		 908 aa  461  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.268462  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1998  CoA-binding domain-containing protein  40.48 
 
 		 977 aa  449  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0769955 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  37.37 
 
 		 911 aa  446  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1694  GCN5-related N-acetyltransferase  40.54 
 
 		 926 aa  446  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133796  normal  0.55865 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1311  hypothetical protein  38.08 
 
 		 886 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  36.71 
 
 		 926 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2486  GCN5-related N-acetyltransferase  35.3 
 
 		 771 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  37.36 
 
 		 904 aa  400  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0615  GCN5-related N-acetyltransferase  41.42 
 
 		 775 aa  402  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.47112  normal  0.466486 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15880  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  40.92 
 
 		 831 aa  393  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00274098  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  33.75 
 
 		 898 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0505  CoA-binding domain protein  35.84 
 
 		 887 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1004  GCN5-related N-acetyltransferase  36.45 
 
 		 883 aa  382  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1913  CoA-binding domain protein  33.6 
 
 		 852 aa  357  3.9999999999999996e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2950  CoA-binding  40.06 
 
 		 707 aa  357  5e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.266129 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1200  GCN5-related N-acetyltransferase  43.05 
 
 		 867 aa  345  2.9999999999999997e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  33.53 
 
 		 698 aa  298  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.45 
 
 		 696 aa  294  4e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.57 
 
 		 699 aa  288  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  31.63 
 
 		 700 aa  281  4e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  29.09 
 
 		 915 aa  281  5e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  30.5 
 
 		 711 aa  277  5e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  30.17 
 
 		 669 aa  277  7e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  32.84 
 
 		 698 aa  274  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  30.21 
 
 		 697 aa  272  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  29.81 
 
 		 918 aa  270  7e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  30.78 
 
 		 911 aa  270  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  26.83 
 
 		 698 aa  265  2e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.36 
 
 		 929 aa  263  8e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  29.8 
 
 		 912 aa  261  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  31.34 
 
 		 706 aa  261  5.0000000000000005e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  27.86 
 
 		 701 aa  259  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  28.68 
 
 		 712 aa  259  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  31.18 
 
 		 913 aa  257  6e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  29.67 
 
 		 920 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  30.84 
 
 		 904 aa  252  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  28.1 
 
 		 921 aa  252  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  30.63 
 
 		 696 aa  251  3e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  34.4 
 
 		 897 aa  251  5e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.78 
 
 		 892 aa  246  9.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0886  CoA-binding domain protein  35.15 
 
 		 637 aa  244  6e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.330543  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  29.39 
 
 		 704 aa  241  5e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  28.53 
 
 		 905 aa  238  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  28.94 
 
 		 698 aa  238  5.0000000000000005e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  27.27 
 
 		 697 aa  237  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 		 898 aa  236  9e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.249053  normal  0.200769 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1776  GCN5-related N-acetyltransferase  29.76 
 
 		 898 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.634734 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3654  GCN5-related N-acetyltransferase  32.12 
 
 		 795 aa  236  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.035064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  28.77 
 
 		 707 aa  235  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2428  CoA-binding domain protein  28.37 
 
 		 697 aa  231  6e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.816008  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  29.4 
 
 		 897 aa  230  8e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  26.57 
 
 		 711 aa  229  2e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  29.49 
 
 		 893 aa  229  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  28 
 
 		 895 aa  229  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  32.54 
 
 		 903 aa  228  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  27.86 
 
 		 889 aa  228  4e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  27.13 
 
 		 695 aa  228  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2078  GCN5-related N-acetyltransferase  29.42 
 
 		 896 aa  228  5.0000000000000005e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0450979  normal  0.503964 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  28.63 
 
 		 699 aa  227  6e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  28.25 
 
 		 911 aa  227  8e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2863  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  30.55 
 
 		 886 aa  223  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2867  CoA binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  30.55 
 
 		 886 aa  223  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2979  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  30.55 
 
 		 886 aa  223  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2845  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  30.4 
 
 		 886 aa  223  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  28.55 
 
 		 900 aa  222  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2761  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  30.55 
 
 		 886 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282153  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  30.19 
 
 		 893 aa  221  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1904  CoA-binding  29.67 
 
 		 915 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  30.28 
 
 		 728 aa  218  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2039  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 		 900 aa  217  7e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583899  normal  0.0195221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  29.06 
 
 		 907 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  29.22 
 
 		 704 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  29.25 
 
 		 727 aa  214  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2530  GCN5-related N-acetyltransferase  28.35 
 
 		 896 aa  214  7e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3069  GCN5-related N-acetyltransferase  30.35 
 
 		 887 aa  213  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.835722  hitchhiker  0.00746938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>