38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1201 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1201  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  582  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142595  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  54.76 
 
 		 290 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4212  Bifunctional DNA primase/polymerase  43.41 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567212  normal  0.394336 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.8 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.65 
 
 		 970 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.8 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.59 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  29.23 
 
 		 955 aa  73.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  43.56 
 
 		 599 aa  72.8  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  30.89 
 
 		 746 aa  72.8  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.36 
 
 		 970 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  27.67 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  29.65 
 
 		 717 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  27.54 
 
 		 749 aa  69.7  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  27.67 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1926  bifunctional DNA primase/polymerase  33.23 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.394144  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0062  hypothetical protein  31.49 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  26.92 
 
 		 717 aa  67  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2521  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.71 
 
 		 206 aa  65.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0275963  normal  0.180999 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1451  bifunctional DNA primase/polymerase  31.19 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0151027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  28.73 
 
 		 717 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  35.81 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  25.63 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  26.13 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  32.45 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2527  hypothetical protein  38.82 
 
 		 756 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  33.79 
 
 		 746 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  33.79 
 
 		 746 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3090  bifunctional DNA primase/polymerase  38.82 
 
 		 402 aa  55.8  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00280  hypothetical protein  35.25 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2304  hypothetical protein  31.76 
 
 		 158 aa  46.2  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0886627  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  32.21 
 
 		 667 aa  46.2  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3733  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.55 
 
 		 271 aa  46.2  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06580  DNA primase/polymerase-like protein  37.1 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6679  Bifunctional DNA primase/polymerase  26.35 
 
 		 201 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1983  Bifunctional DNA primase/polymerase  25.75 
 
 		 201 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2837  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  29.21 
 
 		 183 aa  43.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0750475  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3311  hypothetical protein  28.71 
 
 		 1082 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.331245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>