More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0736 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 326 aa  649    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  82.19 
 
 		 303 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  54.67 
 
 		 310 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06160  predicted glycosyltransferase  55.68 
 
 		 288 aa  276  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0796439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  51.6 
 
 		 307 aa  275  8e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  51.05 
 
 		 297 aa  272  5.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  50.17 
 
 		 296 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  50.17 
 
 		 296 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  50.17 
 
 		 296 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6339  glycosyl transferase family 2  55.73 
 
 		 285 aa  265  7e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  51.52 
 
 		 291 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  50.19 
 
 		 301 aa  252  5.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  46.24 
 
 		 305 aa  249  4e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  50.18 
 
 		 301 aa  249  5e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  46.76 
 
 		 291 aa  246  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0736  putative dTDP-rhamnosyl transferase  40.32 
 
 		 281 aa  142  7e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.574558  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  32.55 
 
 		 308 aa  135  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 		 312 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  32.76 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  34.89 
 
 		 336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 324 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 		 290 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 274 aa  115  8.999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  25.45 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 		 318 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  24.73 
 
 		 297 aa  112  9e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  33.99 
 
 		 329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  31.44 
 
 		 318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  27.52 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 		 313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0657  glycosyl transferase family 2  33.98 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  24.41 
 
 		 652 aa  107  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  29 
 
 		 334 aa  106  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 		 318 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 		 360 aa  103  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 289 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  26.44 
 
 		 339 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  36.19 
 
 		 282 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  23.53 
 
 		 296 aa  99.8  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 340 aa  99.4  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0693  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 		 277 aa  99.4  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  26.44 
 
 		 339 aa  99  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 		 308 aa  99  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 		 306 aa  99  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  23.61 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 336 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  25.87 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 		 318 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 340 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0965  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 		 275 aa  97.4  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.253321  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 		 310 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  27.59 
 
 		 320 aa  95.9  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  27.65 
 
 		 705 aa  95.5  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1140  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.62 
 
 		 286 aa  95.1  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 		 324 aa  95.1  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  30.77 
 
 		 274 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  33.62 
 
 		 1644 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  33.62 
 
 		 1644 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 		 299 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 		 303 aa  93.6  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 		 557 aa  93.2  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  32.28 
 
 		 325 aa  93.2  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4485  glycosyl transferase family 2  34.6 
 
 		 312 aa  92.8  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.874808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  29.75 
 
 		 348 aa  92.4  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 		 346 aa  92.8  8e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 		 714 aa  92  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3908  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  28.35 
 
 		 907 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1912  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 		 329 aa  92.4  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2884  glycosyl transferase family protein  23.49 
 
 		 305 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379417  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4004  glycosyl transferase family protein  34.82 
 
 		 327 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  29.96 
 
 		 2401 aa  90.5  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 		 314 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  31.95 
 
 		 287 aa  90.5  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 		 355 aa  90.5  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  22.96 
 
 		 307 aa  89.4  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 		 1739 aa  89.4  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  26.59 
 
 		 318 aa  89  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 		 304 aa  89  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 		 272 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4734  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4373  glycosyl transferase family 2  34.82 
 
 		 327 aa  89  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.14 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>