170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0059 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0059  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  602  1e-171  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  86.38 
 
 
334 aa  520  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5643  hypothetical protein  55.63 
 
 
297 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  52.23 
 
 
304 aa  276  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2620  hypothetical protein  53.49 
 
 
296 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3932  hypothetical protein  48.81 
 
 
286 aa  242  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6698  hypothetical protein  46.26 
 
 
291 aa  237  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3644  hypothetical protein  47.81 
 
 
307 aa  237  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4343  hypothetical protein  46.44 
 
 
288 aa  232  5e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4349  hypothetical protein  45.12 
 
 
324 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3965  hypothetical protein  45.27 
 
 
324 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3854  hypothetical protein  47.8 
 
 
286 aa  227  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357835  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6257  hypothetical protein  46.23 
 
 
285 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.949372  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1545  hypothetical protein  46.31 
 
 
301 aa  223  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  9.35429e-05  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0151  hypothetical protein  48.31 
 
 
283 aa  222  5e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2688  hypothetical protein  46.08 
 
 
286 aa  219  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.566827  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0252  hypothetical protein  45.76 
 
 
290 aa  209  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0952  hypothetical protein  42.33 
 
 
285 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0486  hypothetical protein  43.45 
 
 
303 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0497  hypothetical protein  43.45 
 
 
303 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0508  hypothetical protein  43.45 
 
 
303 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38250  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  40.99 
 
 
280 aa  189  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201502  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1368  hypothetical protein  42.24 
 
 
281 aa  189  6e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233326  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1084  hypothetical protein  43.87 
 
 
276 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0372016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1068  hypothetical protein  43.87 
 
 
276 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1095  hypothetical protein  43.48 
 
 
276 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4154  hypothetical protein  43.91 
 
 
301 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238248  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5005  hypothetical protein  40.43 
 
 
294 aa  186  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1367  hypothetical protein  38.85 
 
 
285 aa  186  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.134083 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3680  putative F420-dependent oxidoreductase  41.82 
 
 
281 aa  184  1e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1083  hypothetical protein  36.73 
 
 
283 aa  184  2e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377526  normal  0.11045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1094  hypothetical protein  36.73 
 
 
283 aa  184  2e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1067  hypothetical protein  36.73 
 
 
283 aa  184  2e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5006  hypothetical protein  38.85 
 
 
287 aa  184  2e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13500  hypothetical protein  39.71 
 
 
285 aa  182  5e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000277953  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1512  hypothetical protein  42.18 
 
 
279 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00633715  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2385  putative F420-dependent oxidoreductase  40.55 
 
 
288 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3207  putative F420-dependent oxidoreductase  42.2 
 
 
272 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5428  hypothetical protein  35.66 
 
 
275 aa  119  8e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.04 
 
 
322 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  28 
 
 
318 aa  99  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5686  hypothetical protein  35.41 
 
 
271 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  28.26 
 
 
318 aa  93.2  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  34.11 
 
 
327 aa  82.4  9e-15  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  31.18 
 
 
283 aa  75.1  1e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  27.9 
 
 
372 aa  73.9  3e-12  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  27.56 
 
 
321 aa  73.2  5e-12  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  29.41 
 
 
330 aa  72  1e-11  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  27.72 
 
 
309 aa  71.2  2e-11  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  26.59 
 
 
301 aa  70.5  3e-11  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  27.02 
 
 
344 aa  70.1  5e-11  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.67 
 
 
352 aa  69.7  5e-11  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  28.34 
 
 
350 aa  69.3  7e-11  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  28.89 
 
 
309 aa  68.9  1e-10  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  28.01 
 
 
350 aa  68.9  1e-10  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  27.11 
 
 
317 aa  67.8  2e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  29.34 
 
 
360 aa  67.8  2e-10  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  26.52 
 
 
349 aa  67  3e-10  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  25.83 
 
 
318 aa  67  3e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  27.04 
 
 
318 aa  67.4  3e-10  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  26.67 
 
 
318 aa  66.6  4e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  27.04 
 
 
318 aa  66.6  5e-10  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  27.04 
 
 
318 aa  66.6  5e-10  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  27.04 
 
 
318 aa  66.6  5e-10  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  26.44 
 
 
318 aa  65.5  1e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.3 
 
 
298 aa  65.1  1e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.27 
 
 
302 aa  65.1  1e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  26.83 
 
 
346 aa  65.5  1e-09  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  26.99 
 
 
335 aa  65.1  1e-09  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  26.39 
 
 
306 aa  65.1  1e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  29.05 
 
 
346 aa  64.7  2e-09  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  27.93 
 
 
360 aa  64.7  2e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  28.92 
 
 
353 aa  63.9  3e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  30.43 
 
 
341 aa  62.8  6e-09  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  28.32 
 
 
311 aa  63.2  6e-09  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  31.4 
 
 
348 aa  62.4  9e-09  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  28.29 
 
 
349 aa  61.6  1e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  30.46 
 
 
339 aa  61.6  1e-08  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  29.12 
 
 
343 aa  61.2  2e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.81 
 
 
339 aa  60.1  4e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  28.06 
 
 
317 aa  60.1  5e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.73 
 
 
351 aa  59.3  7e-08  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
301 aa  59.3  8e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  1.36256e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5315  luciferase family protein  28.32 
 
 
309 aa  58.9  1e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.75 
 
 
336 aa  58.2  2e-07  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  26.55 
 
 
304 aa  57.8  2e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  28.32 
 
 
359 aa  57.4  3e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  24.38 
 
 
343 aa  57  3e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  27.24 
 
 
314 aa  57  4e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  27.88 
 
 
361 aa  57  4e-07  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  26.06 
 
 
350 aa  56.2  6e-07  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  1.62274e-05  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  26.92 
 
 
347 aa  56.6  6e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  9.42783e-06 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  29.04 
 
 
346 aa  56.6  6e-07  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  27.12 
 
 
353 aa  55.8  8e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  27.12 
 
 
353 aa  55.8  8e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.55 
 
 
333 aa  55.8  8e-07  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  27.12 
 
 
348 aa  55.8  9e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2758  Luciferase-like monooxygenase  27.31 
 
 
296 aa  55.1  1e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.1 
 
 
361 aa  55.5  1e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  27.69 
 
 
339 aa  55.1  2e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>