More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0598 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  100 
 
 
427 aa  829    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  44.53 
 
 
418 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  43.27 
 
 
423 aa  300  4e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  37.95 
 
 
413 aa  276  3e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  37.95 
 
 
413 aa  276  3e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 
444 aa  192  8e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 
432 aa  190  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  32.64 
 
 
422 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  32.11 
 
 
422 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  31.85 
 
 
422 aa  179  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  31.48 
 
 
422 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  31.85 
 
 
422 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  31.85 
 
 
422 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  31.85 
 
 
422 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  31.15 
 
 
422 aa  176  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  30.81 
 
 
422 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  31.75 
 
 
422 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 
433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  30.71 
 
 
422 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  30.21 
 
 
390 aa  159  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  30.21 
 
 
390 aa  159  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  28.39 
 
 
434 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  28.39 
 
 
434 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  29.16 
 
 
434 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  28.83 
 
 
434 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  28.39 
 
 
434 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  28.72 
 
 
410 aa  136  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05510  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 
446 aa  136  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354906  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  28.57 
 
 
434 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  28.57 
 
 
431 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  28.32 
 
 
432 aa  133  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1603  putative permease  26.48 
 
 
421 aa  131  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  26.85 
 
 
414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  27.12 
 
 
417 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  26.7 
 
 
417 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  26.7 
 
 
415 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  26.88 
 
 
415 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  26.88 
 
 
417 aa  121  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  25.99 
 
 
415 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  26.98 
 
 
414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  27.21 
 
 
414 aa  117  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0772  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 
431 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  26.95 
 
 
420 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  25.58 
 
 
427 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  26.4 
 
 
420 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  26.4 
 
 
420 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  26.4 
 
 
420 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  22.93 
 
 
1829 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  26.4 
 
 
420 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  26.43 
 
 
420 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 
405 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  23.74 
 
 
412 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  22.28 
 
 
1806 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  25.89 
 
 
420 aa  99  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0293  major facilitator transporter  25.48 
 
 
413 aa  97.8  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  25.18 
 
 
420 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  26.3 
 
 
438 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  26.2 
 
 
435 aa  94.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 
433 aa  94.7  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  26.73 
 
 
418 aa  94.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  23.55 
 
 
406 aa  94  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 
420 aa  93.6  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  22.92 
 
 
1816 aa  93.6  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  22.62 
 
 
1769 aa  93.6  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1443  ABC transporter, permease protein, putative  27.2 
 
 
296 aa  93.2  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  23.27 
 
 
406 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  26.95 
 
 
420 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  25 
 
 
441 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 
441 aa  92  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  25.45 
 
 
413 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  24.44 
 
 
412 aa  90.1  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  25.2 
 
 
412 aa  89.4  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  24.5 
 
 
434 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 
420 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  27.36 
 
 
412 aa  88.6  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 
432 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
420 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  24.32 
 
 
418 aa  87.4  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  21.29 
 
 
1876 aa  87  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 
414 aa  86.7  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 
397 aa  86.3  9e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  24.57 
 
 
474 aa  86.3  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  26.09 
 
 
403 aa  86.3  9e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  22.54 
 
 
425 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  26.75 
 
 
430 aa  85.9  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  23 
 
 
439 aa  86.3  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  23.14 
 
 
411 aa  85.5  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 
440 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  23.6 
 
 
436 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  25.44 
 
 
410 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  22.45 
 
 
415 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  22.04 
 
 
423 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 
410 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0046  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 
405 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  26.02 
 
 
425 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3334  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  22.55 
 
 
1776 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311515  normal  0.562431 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  26.18 
 
 
410 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  22.83 
 
 
2720 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0715236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>