More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0051 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0051  transcriptional regulator  100 
 
 
323 aa  666    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.929929  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0419  arac-family transcriptional regulator  66.67 
 
 
317 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000111496  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  55.38 
 
 
318 aa  371  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4236  transcriptional regulator, AraC family  54.83 
 
 
325 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3186  AraC family transcriptional regulator  52.41 
 
 
333 aa  347  2e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  48.89 
 
 
317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  48.57 
 
 
317 aa  326  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  0.0000298096 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  48.25 
 
 
348 aa  326  4.0000000000000003e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  48.1 
 
 
333 aa  325  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  49.52 
 
 
342 aa  325  7e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  48.87 
 
 
350 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  47.77 
 
 
338 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  48.23 
 
 
341 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  48.23 
 
 
341 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  48.25 
 
 
338 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  48.1 
 
 
333 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  47.74 
 
 
330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  46.33 
 
 
316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0705  AraC family transcriptional regulator  49.04 
 
 
331 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3261  transcriptional regulator, AraC family  48.72 
 
 
337 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127584  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  43.08 
 
 
320 aa  282  6.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  44.59 
 
 
331 aa  281  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  44.59 
 
 
331 aa  281  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  47.92 
 
 
325 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1857  transcriptional regulator, AraC family  43.17 
 
 
342 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  40.06 
 
 
335 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  40.06 
 
 
335 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  39.94 
 
 
335 aa  262  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  39.62 
 
 
335 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  40.88 
 
 
333 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2725  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 
320 aa  242  6e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4139  ThiJ/PfpI domain protein  38.1 
 
 
321 aa  241  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  38.91 
 
 
333 aa  240  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  38.08 
 
 
322 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  37.7 
 
 
329 aa  238  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  37.22 
 
 
326 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  39.14 
 
 
350 aa  238  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  37.42 
 
 
333 aa  237  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  38.75 
 
 
321 aa  236  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  38.63 
 
 
327 aa  235  8e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  40.06 
 
 
326 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1531  transcriptional regulator, AraC family  40.76 
 
 
316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  41.99 
 
 
321 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  42.7 
 
 
321 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  37.3 
 
 
333 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  36.33 
 
 
333 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2150  transcriptional activator FtrA  36.22 
 
 
330 aa  227  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.077741  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  39.45 
 
 
324 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  37.22 
 
 
347 aa  227  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  39.79 
 
 
324 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  36.31 
 
 
324 aa  226  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  40.28 
 
 
321 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  37.85 
 
 
340 aa  225  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  38.07 
 
 
332 aa  225  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  35.42 
 
 
331 aa  224  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  39.36 
 
 
318 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  39.58 
 
 
320 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  37.97 
 
 
362 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  36.39 
 
 
326 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  39.01 
 
 
318 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  39.58 
 
 
324 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  39.01 
 
 
318 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  39.01 
 
 
318 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  36.08 
 
 
326 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  39.01 
 
 
318 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  36.08 
 
 
326 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  39.01 
 
 
318 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  39.72 
 
 
320 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  39.72 
 
 
320 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  37.94 
 
 
328 aa  222  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  40.07 
 
 
324 aa  222  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3112  ThiJ/PfpI domain protein  36.56 
 
 
321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226454  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 
334 aa  220  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  35.81 
 
 
333 aa  220  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  36.74 
 
 
317 aa  219  5e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  39.12 
 
 
327 aa  218  7.999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  35.9 
 
 
323 aa  218  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4599  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 
332 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  37.54 
 
 
330 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 
320 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  37.69 
 
 
317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  36.31 
 
 
331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  37.06 
 
 
322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  38.06 
 
 
317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2051  transcriptional regulator, AraC family  38.78 
 
 
344 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  38.7 
 
 
328 aa  212  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  39.79 
 
 
334 aa  212  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  34.71 
 
 
320 aa  212  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2133  transcriptional regulator, AraC family  33.23 
 
 
321 aa  212  7e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 
313 aa  212  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  34.97 
 
 
325 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  37.26 
 
 
356 aa  210  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  35.86 
 
 
335 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6432  AraC family transcriptional regulator  37.17 
 
 
332 aa  209  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4142  transcriptional regulator, AraC family  32.59 
 
 
318 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00637596  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1760  transcriptional activator FtrA  37.23 
 
 
318 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  36.31 
 
 
316 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  37.23 
 
 
339 aa  205  8e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5179  transcriptional regulator, AraC family  38.53 
 
 
352 aa  205  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>