93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2962 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2962  putative transcriptional antiterminator  100 
 
 		 274 aa  549  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3480  transcriptional antiterminator, BglG  36.57 
 
 		 276 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1703  transcriptional antiterminator, BglG  34.44 
 
 		 283 aa  149  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00651632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0783  transcriptional antiterminator, BglG  33.7 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000203028  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1666  transcriptional antiterminator, BglG  33.09 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000414905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0858  BglG family transcriptional antiterminator  33.95 
 
 		 282 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0876  BigG family transcription antiterminator  33.95 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019632  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0414  transcriptional antiterminator, BglG  34.07 
 
 		 275 aa  142  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2549  transcriptional antiterminator, BglG  39.55 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2440  transcriptional antiterminator, BglG  31.97 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000609251  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2743  transcriptional antiterminator, BglG  31.25 
 
 		 287 aa  135  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00574761  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3508  transcriptional antiterminator, BglG  34.68 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2325  transcriptional antiterminator, BglG  31.05 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1406  transcriptional antiterminator, BglG  34.65 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2741  transcriptional antiterminator, BglG  29.74 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0375985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0742  transcriptional antiterminator, BglG  32.33 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0978  transcriptional antiterminator, BglG  32.84 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0759  transcriptional antiterminator, BglG  32.72 
 
 		 278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3880  transcriptional antiterminator, BglG  36 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00851462  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1328  transcriptional antiterminator, BglG  30.55 
 
 		 278 aa  126  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172208  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0900  beta-glucoside operon antiterminator  28.37 
 
 		 286 aa  126  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4160  transcription antiterminator GlcT  35.56 
 
 		 282 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000367123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1078  transcription antiterminator GlcT  36 
 
 		 282 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000114495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4270  transcription antiterminator GlcT  36 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3807  BigG family transcription antiterminator  36 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112733  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4071  transcription antiterminator GlcT  36 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3792  BigG family transcription antiterminator  36 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0611952  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3961  transcription antiterminator GlcT  36 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.222573  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0762  transcriptional antiterminator, BglG  30.37 
 
 		 281 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4118  transcription antiterminator GlcT  36 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129448  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0746  transcriptional antiterminator, BglG  29.37 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4182  transcription antiterminator GlcT  36 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1784  transcriptional antiterminator, BglG  31.7 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2750  transcriptional antiterminator, BglG  33.78 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00540067  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0789  transcriptional antiterminator LicT  30.91 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1756  beta-glucoside operon antiterminator  28.47 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000280002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1890  transcriptional antiterminator, BglG  29.78 
 
 		 276 aa  119  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0093026  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1546  beta-glucoside operon antiterminator  28.46 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3966  transcriptional antiterminator, BglG  28 
 
 		 278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0910  transcriptional antiterminator, BglG  35.56 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000476209  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0333  transcriptional antiterminator, BglG  30.6 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4271  transcriptional antiterminator BglG  29.78 
 
 		 278 aa  112  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4244  transcriptional antiterminator, BglG  29.78 
 
 		 278 aa  112  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3937  transcriptional antiterminator BglG  29.78 
 
 		 278 aa  112  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4233  transcriptional antiterminator BglG  29.78 
 
 		 278 aa  112  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1354  transcriptional antiterminator, BglG  33.64 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1758  beta-glucoside operon antiterminator  30.84 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.798018  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03551  hypothetical protein  29.33 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03607  transcriptional antiterminator of the bgl operon  29.33 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0473  transcriptional antiterminator, BglG  28.89 
 
 		 282 aa  108  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0915311  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0928  transcriptional antiterminator LicT, putative  31.51 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1049  transcriptional antiterminator, BglG  28.25 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1460  transcriptional antiterminator, BglG  29.49 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000872173  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1347  transcriptional antiterminator, BglG  26.01 
 
 		 279 aa  105  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0131175  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0069  transcription antiterminator  26.97 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0091  SACPA operon antiterminator (sacT)  28.83 
 
 		 282 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3469  transcriptional antiterminator, BglG  30.28 
 
 		 285 aa  99.8  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000622691  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1670  transcriptional antiterminator  29.93 
 
 		 292 aa  99  7e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0701104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1446  CAT RNA-binding domain-containing protein  32.89 
 
 		 283 aa  95.9  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104494  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1419  transcription antiterminator  32.89 
 
 		 283 aa  95.9  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.266427  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2960  transcriptional antiterminator, BglG  28.77 
 
 		 281 aa  94.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000296432  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0888  transcriptional antiterminator, BglG  27.75 
 
 		 289 aa  92.8  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4205  cryptic beta-glucoside bgl operon antiterminator  32.26 
 
 		 164 aa  85.9  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0341  beta-glucoside operon antiterminator  25.27 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223253  hitchhiker  0.0000011111 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0499  beta-glucoside operon antiterminator  24.3 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000340266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2133  PTS system transcriptional activator  27.34 
 
 		 892 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0261  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  29.13 
 
 		 901 aa  65.1  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5635  transcription antiterminator, BglG family  31.18 
 
 		 891 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.396867  hitchhiker  0.00000000250243 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5324  transcription antiterminator, BglG family  30.11 
 
 		 891 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5369  transcription antiterminator, BglG family  29.03 
 
 		 891 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000331131  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5314  BigG family transcription antiterminator  29.03 
 
 		 550 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3748  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  28 
 
 		 897 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00968283  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5293  transcription antiterminator, BglG family  27.96 
 
 		 891 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211456 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4997  PTS system transcriptional activator  30.11 
 
 		 892 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0120  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  34.13 
 
 		 977 aa  60.1  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5437  BigG family transcription antiterminator  27.96 
 
 		 891 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.250784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4897  transcriptional antiterminator  27.96 
 
 		 891 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0871125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4882  transcriptional antiterminator  27.96 
 
 		 891 aa  59.7  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5052  BigG family transcription antiterminator  27.96 
 
 		 891 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.309517  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0221  transcriptional antiterminator, BglG  33.75 
 
 		 674 aa  58.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1683  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  27.08 
 
 		 646 aa  54.3  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0237  transcriptional antiterminator, BglG  27 
 
 		 705 aa  54.7  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3395  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25 
 
 		 661 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20170  transcriptional antiterminator, BglG  25.47 
 
 		 741 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0269  transcriptional antiterminator, BglG  29.87 
 
 		 680 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1587  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  28.57 
 
 		 625 aa  48.1  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  30.16 
 
 		 692 aa  46.2  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  27.37 
 
 		 652 aa  45.8  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0232  transcriptional antiterminator  32.61 
 
 		 496 aa  44.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1846  transcriptional antiterminator, BglG  35 
 
 		 685 aa  42.4  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0701  transcriptional antiterminator, BglG  24.6 
 
 		 646 aa  42.7  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2796  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  21.97 
 
 		 696 aa  42.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1382  transcriptional antiterminator, BglG  30.16 
 
 		 681 aa  42.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>