182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00955 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00955  paraquat-inducible protein B  100 
 
 
546 aa  1117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.62354e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1139  paraquat-inducible protein B  89.19 
 
 
546 aa  1006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0102675  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1115  paraquat-inducible protein B  99.63 
 
 
546 aa  1115  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000291875  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1652  paraquat-inducible protein B  66.79 
 
 
548 aa  763  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1463  paraquat-inducible protein B  85.87 
 
 
545 aa  978  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0560595  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1683  paraquat-inducible protein B  67.52 
 
 
548 aa  771  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1066  paraquat-inducible protein B  100 
 
 
546 aa  1117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  8.23988e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1990  paraquat-inducible protein B  69.44 
 
 
550 aa  784  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2168  paraquat-inducible protein B  99.82 
 
 
546 aa  1115  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  7.64872e-05  normal  0.254429 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2549  paraquat-inducible protein B  69.44 
 
 
550 aa  784  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0824615  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2645  paraquat-inducible protein B  100 
 
 
546 aa  1117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000298494  hitchhiker  4.76211e-06 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2067  paraquat-inducible protein B  67.1 
 
 
546 aa  761  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.883854  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1746  paraquat-inducible protein B  68.5 
 
 
548 aa  792  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  decreased coverage  7.31619e-07 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2638  paraquat-inducible protein B  69.44 
 
 
550 aa  784  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1022  paraquat-inducible protein B  89.19 
 
 
546 aa  1006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0366  paraquat-inducible protein B  67.03 
 
 
547 aa  765  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.838729  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2692  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 
546 aa  1117  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  6.10454e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1127  paraquat-inducible protein B  89.19 
 
 
546 aa  1008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0201216  normal  0.953621 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1173  paraquat-inducible protein B  89.19 
 
 
546 aa  1006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371767  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00962  hypothetical protein  100 
 
 
546 aa  1117  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  3.79419e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1105  paraquat-inducible protein B  89.38 
 
 
546 aa  1008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486337  normal  0.0294366 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4853  paraquat-inducible protein B  67.22 
 
 
547 aa  766  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098113 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2366  paraquat-inducible protein B  99.45 
 
 
546 aa  1112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1794  paraquat-inducible protein B  67.28 
 
 
555 aa  763  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1060  paraquat-inducible protein B  100 
 
 
546 aa  1117  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.2177e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003028  paraquat-inducible protein B  43.69 
 
 
548 aa  491  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1352  paraquat-inducible protein B  44.69 
 
 
547 aa  486  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.73869e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02851  hypothetical protein  42.44 
 
 
548 aa  477  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2008  hypothetical protein  42.91 
 
 
547 aa  468  1e-130  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1920  hypothetical protein  41.92 
 
 
554 aa  444  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.976156  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1865  hypothetical protein  41.62 
 
 
554 aa  438  1e-122  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0867784 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2113  hypothetical protein  41.44 
 
 
554 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.696493  normal  0.025726 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2722  paraquat-inducible protein B  40.91 
 
 
550 aa  437  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2932  hypothetical protein  40.18 
 
 
548 aa  433  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2074  hypothetical protein  40.67 
 
 
550 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0955309  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3077  putative paraquat-inducible protein B  35.18 
 
 
580 aa  376  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.198785  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1704  hypothetical protein  35.11 
 
 
554 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02656  putative paraquat-inducible protein B  36.23 
 
 
555 aa  363  4e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0257  hypothetical protein  36.35 
 
 
543 aa  326  5e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0363  paraquat-inducible protein B  34.6 
 
 
572 aa  313  4e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0328  Mammalian cell entry related domain protein  35.49 
 
 
552 aa  311  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2893  Mammalian cell entry related domain protein  35.32 
 
 
548 aa  309  8e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.3428  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3376  hypothetical protein  32.1 
 
 
559 aa  301  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166606  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44090  PqiB family protein  35.53 
 
 
537 aa  296  5e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.760607  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2679  hypothetical protein  33.21 
 
 
546 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.331347  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0579  hypothetical protein  32.68 
 
 
546 aa  287  3e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30623  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2378  paraquat-inducible protein B  34.12 
 
 
553 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1154  paraquat-inducible protein B  34.26 
 
 
551 aa  286  6e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2561  mce family protein  34.26 
 
 
551 aa  286  6e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0292  paraquat-inducible protein B  34.26 
 
 
551 aa  286  6e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3374  mce family protein  34.12 
 
 
551 aa  285  2e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3382  paraquat-inducible protein  34.12 
 
 
551 aa  285  2e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3340  paraquat-inducible protein B  33.93 
 
 
551 aa  283  4e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440052  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2127  putative paraquat-inducible transmembrane protein, PqiB  33.71 
 
 
539 aa  283  6e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460028  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1268  paraquat-inducible protein B  34.71 
 
 
551 aa  282  9e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0651  hypothetical protein  35.4 
 
 
534 aa  282  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.1317  normal  0.879007 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2114  Mammalian cell entry related domain protein  33.33 
 
 
539 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2674  hypothetical protein  32.81 
 
 
539 aa  279  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531712  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0711  hypothetical protein  32.87 
 
 
539 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0227  hypothetical protein  32.87 
 
 
539 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3799  hypothetical protein  33.14 
 
 
539 aa  277  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660029  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0678  hypothetical protein  32.87 
 
 
539 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0419217  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5506  hypothetical protein  35.06 
 
 
533 aa  277  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.286213  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3535  hypothetical protein  32.29 
 
 
531 aa  276  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128458  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2221  Mammalian cell entry related domain protein  33.74 
 
 
556 aa  276  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.38523e-06 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0602  hypothetical protein  33.46 
 
 
539 aa  275  1e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483664  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0626  hypothetical protein  33.46 
 
 
539 aa  275  1e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735429  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3509  fibronectin, type III  31.19 
 
 
537 aa  271  3e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.736082  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0530  Mammalian cell entry related domain protein  33.4 
 
 
547 aa  269  8e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0517  Mammalian cell entry related domain protein  33.4 
 
 
547 aa  269  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0709  Mammalian cell entry related domain protein  32.35 
 
 
552 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381837  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2000  Mammalian cell entry related domain protein  31.11 
 
 
558 aa  268  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939676  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4088  paraquat-inducible protein B  35.87 
 
 
508 aa  267  3e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141129  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4000  putative paraquat-inducible protein  32.35 
 
 
552 aa  267  3e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.113556  normal  0.829107 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2535  hypothetical protein  32.61 
 
 
544 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0601  hypothetical protein  32.93 
 
 
547 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.184325  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3242  Mammalian cell entry related domain protein  32.7 
 
 
555 aa  265  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5802  hypothetical protein  32.36 
 
 
531 aa  264  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00328946  hitchhiker  0.0014272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0040  paraquat-inducible protein  31.99 
 
 
569 aa  263  6e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00684202  normal  0.214843 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5278  hypothetical protein  33.46 
 
 
531 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1445  Mammalian cell entry related domain protein  30.19 
 
 
547 aa  258  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0403  hypothetical protein  31.27 
 
 
545 aa  256  7e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3179  PqiB family protein  29.96 
 
 
559 aa  256  8e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6816  paraquat-inducible protein B'  32.38 
 
 
556 aa  256  1e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  0.938789 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3045  PqiB family protein  29.78 
 
 
559 aa  253  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114944  normal  0.0226159 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3139  hypothetical protein  31.05 
 
 
546 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667877  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3288  hypothetical protein  31.12 
 
 
546 aa  250  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2577  hypothetical protein  30.67 
 
 
546 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122207  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2831  hypothetical protein  31.54 
 
 
551 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2580  hypothetical protein  31.14 
 
 
551 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.732971 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1323  Mammalian cell entry related domain protein  30 
 
 
561 aa  234  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.404082  normal  0.550075 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3328  hypothetical protein  29.63 
 
 
694 aa  231  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.901171  normal  0.708038 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2562  hypothetical protein  32.42 
 
 
558 aa  230  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0758211  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1570  hypothetical protein  29.18 
 
 
538 aa  226  8e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2391  hypothetical protein  31.61 
 
 
545 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931506  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2692  hypothetical protein  29.38 
 
 
688 aa  207  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1571  virulence factor MCE-like protein-related protein  28.02 
 
 
808 aa  199  9e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.645853  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5396  hypothetical protein  32.69 
 
 
768 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62020  paraquat-inducible protein B-like protein  32.69 
 
 
768 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0157201 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42450  hypothetical protein  31.73 
 
 
771 aa  174  4e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>