197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2946 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  100 
 
 		 202 aa  417  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2089  Rubrerythrin  91.58 
 
 		 202 aa  387  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3337  nigerythrin  85.15 
 
 		 202 aa  363  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0398  Rubrerythrin  76.24 
 
 		 200 aa  301  3.0000000000000004e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.849916 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  63.45 
 
 		 263 aa  265  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  38.42 
 
 		 166 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  42.11 
 
 		 158 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  41.38 
 
 		 164 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  40 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  36.84 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  38.69 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  33.33 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  38.29 
 
 		 168 aa  106  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  37.93 
 
 		 164 aa  105  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  39.43 
 
 		 166 aa  105  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  39.39 
 
 		 163 aa  105  7e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  35.91 
 
 		 185 aa  104  8e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  38.2 
 
 		 165 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  40.48 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  37.72 
 
 		 164 aa  101  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  36.53 
 
 		 164 aa  101  9e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  40 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  36.78 
 
 		 179 aa  99.8  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  42.26 
 
 		 166 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  37.14 
 
 		 166 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  38.32 
 
 		 164 aa  99.4  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  37.14 
 
 		 168 aa  98.6  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  35.39 
 
 		 165 aa  97.8  8e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  35.39 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  35.39 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  30.51 
 
 		 185 aa  97.4  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  39.18 
 
 		 166 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  37.14 
 
 		 166 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  40.48 
 
 		 166 aa  97.1  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  39.29 
 
 		 166 aa  96.7  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  37.71 
 
 		 166 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  34.29 
 
 		 166 aa  96.7  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  37.8 
 
 		 167 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  38.69 
 
 		 165 aa  96.3  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  38.69 
 
 		 166 aa  96.3  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  34.36 
 
 		 168 aa  96.3  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  37.14 
 
 		 166 aa  95.9  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  33.71 
 
 		 165 aa  95.9  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  35.71 
 
 		 167 aa  96.3  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  33.71 
 
 		 166 aa  95.1  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  31.64 
 
 		 169 aa  94.7  7e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  28.81 
 
 		 182 aa  94.7  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  40.22 
 
 		 166 aa  94.4  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  37.43 
 
 		 179 aa  94.4  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  32.6 
 
 		 184 aa  94  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  36.81 
 
 		 168 aa  94  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  32.2 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  39.88 
 
 		 166 aa  93.6  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  34.95 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  35.71 
 
 		 165 aa  93.6  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  34.55 
 
 		 168 aa  92.8  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  35.75 
 
 		 191 aa  92.8  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  34.22 
 
 		 192 aa  92.8  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  32.21 
 
 		 233 aa  91.7  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  35 
 
 		 167 aa  91.3  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  35.29 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  34.83 
 
 		 173 aa  91.3  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  34.55 
 
 		 168 aa  90.9  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  32.09 
 
 		 194 aa  90.9  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  33.91 
 
 		 183 aa  89.7  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  35 
 
 		 190 aa  89.4  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  36.52 
 
 		 178 aa  89.4  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  35.48 
 
 		 191 aa  89.7  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  34.62 
 
 		 197 aa  89.4  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  32.62 
 
 		 194 aa  89.7  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  33.91 
 
 		 183 aa  89.7  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  36.87 
 
 		 190 aa  89.4  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  36.87 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  36.47 
 
 		 696 aa  89.4  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  33.91 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  36.26 
 
 		 190 aa  89.4  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2617  Rubrerythrin  33.33 
 
 		 202 aa  88.6  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  36.72 
 
 		 696 aa  88.6  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  34.09 
 
 		 166 aa  89  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  33.33 
 
 		 169 aa  89  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  33.33 
 
 		 183 aa  88.6  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  31.25 
 
 		 184 aa  88.2  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  32.09 
 
 		 194 aa  87.8  9e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  34.64 
 
 		 180 aa  87.8  9e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  34.22 
 
 		 192 aa  87.8  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  34.32 
 
 		 166 aa  87.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  37.57 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  34.25 
 
 		 170 aa  86.7  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  32.07 
 
 		 170 aa  87  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  32.07 
 
 		 170 aa  87  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  27.68 
 
 		 184 aa  86.3  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  34.08 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  34.66 
 
 		 166 aa  85.9  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  33.52 
 
 		 191 aa  85.9  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  33.87 
 
 		 191 aa  85.1  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  32.4 
 
 		 191 aa  85.1  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  36.57 
 
 		 166 aa  85.1  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  36.87 
 
 		 192 aa  84.7  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  33.71 
 
 		 163 aa  84.7  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  33.33 
 
 		 179 aa  84.7  9e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>