47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0140 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0140  putative lipoprotein  100 
 
 		 226 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0037  hypothetical protein  68.58 
 
 		 226 aa  320  8e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2734  putative lipoprotein  45.27 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0689  hypothetical protein  31.05 
 
 		 227 aa  115  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3853  hypothetical protein  29.15 
 
 		 231 aa  111  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.182683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2669  hypothetical protein  33.78 
 
 		 233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1080  putative lipoprotein  30.88 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00439977  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1467  hypothetical protein  33.33 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3499  hypothetical protein  26.7 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2705  hypothetical protein  30.53 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0400  hypothetical protein  30 
 
 		 233 aa  88.6  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3853  hypothetical protein  33.03 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2569  hypothetical protein  29.89 
 
 		 225 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3047  putative lipoprotein  31.61 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.566933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2583  hypothetical protein  28.44 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2710  hypothetical protein  30.32 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3145  hypothetical protein  28.8 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2516  hypothetical protein  30.95 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1978  putative outer membrane lipoprotein  29.38 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.931993 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3250  hypothetical protein  32.62 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20600  hypothetical protein  33.51 
 
 		 224 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000461916  normal  0.707445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1768  putative lipoprotein  33.69 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1724  putative lipoprotein  26.32 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0895113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1721  putative lipoprotein  26.32 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1785  hypothetical protein  26.32 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1735  putative lipoprotein  26.32 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1554  putative lipoprotein  26.32 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1609  putative lipoprotein  28.12 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2036  putative lipoprotein  28.12 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000423707  unclonable  9.72589e-25 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01399  hypothetical protein  28.12 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2216  conserved hypothetical protein  28.12 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.90262  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1744  putative lipoprotein  28.12 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000116724  unclonable  1.13256e-21 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2229  hypothetical protein  28.12 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1513  putative lipoprotein  28.12 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01388  predicted lipoprotein  28.12 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3873  hypothetical protein  25.91 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33730  hypothetical protein  30.05 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3425  putative lipoprotein  24.72 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3695  hypothetical protein  25 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.54497 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6350  putative lipoprotein  22.22 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.483058 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0167  hypothetical protein  31.31 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5161  hypothetical protein  26.47 
 
 		 221 aa  48.9  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183646 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1448  putative lipoprotein  26.72 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288417  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1604  hypothetical protein  23.65 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0355335  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3729  hypothetical protein  23.04 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2390  hypothetical protein  23.24 
 
 		 220 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  0.832106 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2561  putative lipoprotein  19.55 
 
 		 237 aa  41.6  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.45576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>