122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0175 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0175  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 
176 aa  350  5e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121367 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1978  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  60.59 
 
 
174 aa  231  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.248725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2969  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  64.02 
 
 
172 aa  223  9e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2856  hypothetical protein  58.48 
 
 
175 aa  216  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1597  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  64.33 
 
 
170 aa  215  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1868  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50.28 
 
 
180 aa  180  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3015  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  61.07 
 
 
133 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2310  YeeE/YedE family protein  47.5 
 
 
173 aa  144  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1168  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.38 
 
 
172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.709858  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0801  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40.49 
 
 
171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.897087  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0624  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.1 
 
 
175 aa  124  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3682  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  43.27 
 
 
180 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1695  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.46 
 
 
181 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000630724 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1629  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.51 
 
 
175 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.301211 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4308  hypothetical protein  41.07 
 
 
174 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  38.62 
 
 
344 aa  78.2  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0788  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.5 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0768937  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1156  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.76 
 
 
407 aa  77.8  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.643231  normal  0.0925546 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.62 
 
 
352 aa  77.8  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3344  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.91 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2596  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.71 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2804  hypothetical protein  35.07 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0812  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.72 
 
 
462 aa  70.5  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1835  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.84 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0512  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.93 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2678  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.96 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.782906  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1214  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.02 
 
 
100 aa  63.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0826897  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4882  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.92 
 
 
187 aa  61.6  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437819  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2423  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.58 
 
 
174 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.14 
 
 
368 aa  60.1  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6934  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.8 
 
 
191 aa  59.3  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4108  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.89 
 
 
169 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.629553  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1366  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.56 
 
 
182 aa  58.5  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1028  hypothetical protein  28.73 
 
 
185 aa  57.4  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.637792  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  27.49 
 
 
373 aa  57  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0269  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.15 
 
 
187 aa  55.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2716  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.47 
 
 
171 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.653376  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2811  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.47 
 
 
171 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647947  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3331  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.65 
 
 
186 aa  55.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286233  hitchhiker  0.0021122 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1463  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.36 
 
 
165 aa  55.5  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  30.26 
 
 
359 aa  55.5  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0855  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.74 
 
 
142 aa  55.1  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000829035 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  42.39 
 
 
385 aa  54.7  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0171  YeeE/YedE  29.45 
 
 
162 aa  54.3  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.96637  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11778  hypothetical protein  30.27 
 
 
185 aa  53.9  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0556  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.86 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.73 
 
 
412 aa  52  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1499  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.61 
 
 
162 aa  52  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3116  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.04 
 
 
191 aa  52  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  28.74 
 
 
352 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.34 
 
 
334 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  28.74 
 
 
352 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  28.74 
 
 
349 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  29.34 
 
 
352 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  28.74 
 
 
352 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000102  DUF395 domain-containing protein  28.3 
 
 
139 aa  49.7  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268388  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.74 
 
 
352 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4161  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.36 
 
 
360 aa  48.9  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0682  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.25 
 
 
190 aa  48.9  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3387  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.18 
 
 
184 aa  48.5  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.487113  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4315  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.68 
 
 
168 aa  48.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  28.14 
 
 
352 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4076  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.11 
 
 
143 aa  48.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0200066  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  27.78 
 
 
394 aa  47.8  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1489  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.33 
 
 
412 aa  47.8  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3555  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.02 
 
 
127 aa  47.8  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0739  hypothetical protein  31.4 
 
 
371 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2608  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.57 
 
 
186 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0585  hypothetical protein  28.3 
 
 
139 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  31.25 
 
 
359 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  31.25 
 
 
359 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0191  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.65 
 
 
145 aa  47  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3909  hypothetical protein  31.82 
 
 
353 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.192183 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4036  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.08 
 
 
144 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33 
 
 
330 aa  46.2  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2997  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.67 
 
 
187 aa  45.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207373  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0178  hypothetical protein  31.96 
 
 
145 aa  45.4  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0891988 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0799  YeeE/YedE  29.07 
 
 
373 aa  45.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236196  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2350  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34 
 
 
144 aa  45.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1883  YeeE/YedE family membrane protein  31.25 
 
 
144 aa  45.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2630  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.3 
 
 
171 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0047  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.64 
 
 
180 aa  45.1  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3703  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.74 
 
 
185 aa  45.1  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.81 
 
 
354 aa  44.7  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02370  conserved hypothetical protein  33.66 
 
 
348 aa  44.7  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.621696  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2224  hypothetical protein  34.78 
 
 
421 aa  44.7  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2497  integral membrane protein  25.47 
 
 
139 aa  44.3  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0258  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.3 
 
 
163 aa  43.9  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1086  YeeE/YedE family protein  33.67 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2671  hypothetical protein  27.59 
 
 
371 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00350575  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2177  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.21 
 
 
132 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.385456  normal  0.163167 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2107  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.17 
 
 
159 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0938  YeeE/YedE family protein  38.16 
 
 
144 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0358  YeeE/YedE family protein  38.16 
 
 
144 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.02 
 
 
140 aa  42.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3645  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.83 
 
 
143 aa  42.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301745  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1813  YeeE/YedE family protein  38.16 
 
 
144 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1403  YeeE/YedE family protein  38.16 
 
 
144 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.14374  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0372  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.38 
 
 
415 aa  42.7  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12633  hypothetical protein  45.45 
 
 
185 aa  42.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.318164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>