More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0631 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
121 aa  240  3.9999999999999997e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  54.24 
 
 
126 aa  140  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  53.39 
 
 
126 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  53.39 
 
 
126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  53.39 
 
 
126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  53.39 
 
 
126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  53.39 
 
 
126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  53.39 
 
 
126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  53.39 
 
 
126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  53.33 
 
 
126 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  52.54 
 
 
126 aa  137  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  51.28 
 
 
121 aa  134  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  52.14 
 
 
126 aa  134  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2337  transcriptional regulator, GntR family  50.45 
 
 
119 aa  118  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  48.28 
 
 
125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  45.69 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1919  transcriptional regulator, GntR family  44.54 
 
 
129 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1515  regulatory protein GntR, HTH  41.82 
 
 
120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0938  GntR family transcriptional regulator  41.88 
 
 
122 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1279  GntR family transcriptional regulator  39.64 
 
 
125 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00230471  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1629  transcriptional regulator, GntR family  39.81 
 
 
121 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1621  GntR family transcriptional regulator  45.13 
 
 
123 aa  103  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1402  GntR family transcriptional regulator, putative  41.53 
 
 
125 aa  102  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2285  GntR family transcriptional regulator  44.34 
 
 
118 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  44.34 
 
 
118 aa  101  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  45.87 
 
 
120 aa  98.6  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  42.61 
 
 
133 aa  97.8  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  47.79 
 
 
139 aa  97.1  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  47.79 
 
 
139 aa  97.1  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  46.9 
 
 
139 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  46.9 
 
 
139 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  46.9 
 
 
139 aa  96.3  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  46.9 
 
 
139 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  46.9 
 
 
139 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  46.9 
 
 
139 aa  95.9  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  46.9 
 
 
139 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  46.9 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0365  transcriptional regulator, GntR family  43.52 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2154  GntR family transcriptional regulator  42.61 
 
 
125 aa  94  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  46.9 
 
 
139 aa  94  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1108  transcriptional regulator  38.33 
 
 
122 aa  91.7  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0952489  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0430  transcriptional regulator, GntR family  41.96 
 
 
130 aa  91.3  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  45.24 
 
 
129 aa  90.5  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0169  transcriptional regulator, GntR family  40.52 
 
 
123 aa  89.4  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  41.59 
 
 
126 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  40.8 
 
 
128 aa  87.8  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  42.61 
 
 
122 aa  85.9  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2235  GntR family transcriptional regulator  38.26 
 
 
117 aa  84.3  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  41.18 
 
 
137 aa  84  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  37.61 
 
 
131 aa  82.8  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2547  transcriptional regulator, GntR family  34.51 
 
 
123 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.136131  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  38.68 
 
 
125 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  44.9 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  36.75 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1007  GntR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
123 aa  79.7  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1243  transcriptional regulator, GntR family  38.53 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.157686  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  41.44 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  41.23 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  49.25 
 
 
482 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1206  GntR family transcriptional regulator  38.74 
 
 
119 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0894307 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  49.25 
 
 
482 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  48.57 
 
 
482 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
482 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  34.91 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  49.25 
 
 
482 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  49.25 
 
 
477 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  49.25 
 
 
482 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  49.25 
 
 
482 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  49.25 
 
 
482 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  49.25 
 
 
482 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
123 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0436  GntR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
123 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0050  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.898353  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3575  transcriptional regulator, GntR family  36.28 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00235324  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1345  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117764  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1803  GntR family transcriptional regulator  47.3 
 
 
123 aa  75.1  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1122  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 
125 aa  73.9  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379756 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6591  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
130 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30942  normal  0.691161 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0664  GntR family transcriptional regulator  47.19 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3903  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000301963  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7289  transcriptional regulator, GntR family  42.27 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3111  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  33.88 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0882  transcriptional regulator, GntR family  36.89 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.905481  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5187  transcriptional regulator, GntR family  32.77 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  41.94 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>