166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3484 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  100 
 
 		 192 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  99.48 
 
 		 192 aa  370  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  86.46 
 
 		 192 aa  330  9e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  81.52 
 
 		 204 aa  306  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0520  hypothetical protein  84.57 
 
 		 187 aa  298  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  79.89 
 
 		 188 aa  294  5e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  74.05 
 
 		 188 aa  275  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  73.37 
 
 		 196 aa  270  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5289  protein of unknown function UPF0016  76.92 
 
 		 187 aa  267  5.9999999999999995e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  71.58 
 
 		 191 aa  260  6.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  66.67 
 
 		 203 aa  254  5e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  69.02 
 
 		 190 aa  253  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  65.78 
 
 		 204 aa  245  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  66.67 
 
 		 190 aa  238  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  66.1 
 
 		 190 aa  238  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  66.84 
 
 		 206 aa  237  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  67.03 
 
 		 191 aa  234  7e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  61.96 
 
 		 218 aa  234  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  61.75 
 
 		 218 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  61.75 
 
 		 190 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  60.87 
 
 		 190 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  61.75 
 
 		 190 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  61.75 
 
 		 218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  61.75 
 
 		 218 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  61.17 
 
 		 190 aa  232  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  61.17 
 
 		 190 aa  232  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  61.17 
 
 		 190 aa  232  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  61.17 
 
 		 190 aa  232  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  61.17 
 
 		 190 aa  232  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  61.17 
 
 		 190 aa  232  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  61.17 
 
 		 190 aa  232  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  60.11 
 
 		 190 aa  228  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  59.78 
 
 		 234 aa  228  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2039  protein of unknown function UPF0016  60.87 
 
 		 196 aa  225  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589069  hitchhiker  0.00000000898807 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  60.33 
 
 		 190 aa  224  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  54.64 
 
 		 185 aa  223  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  60.87 
 
 		 193 aa  223  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0887  hypothetical protein  66.84 
 
 		 241 aa  221  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159087  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  53.55 
 
 		 185 aa  218  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0447  hypothetical protein  58.7 
 
 		 191 aa  204  5e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  59.78 
 
 		 194 aa  204  8e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  59.24 
 
 		 194 aa  202  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1438  protein of unknown function UPF0016  56.76 
 
 		 195 aa  197  7e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  52.97 
 
 		 191 aa  195  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  55.43 
 
 		 188 aa  195  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0802  hypothetical protein  58.06 
 
 		 194 aa  194  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  57.07 
 
 		 194 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3666  hypothetical protein  61.31 
 
 		 194 aa  193  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4428  hypothetical protein  58.2 
 
 		 194 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  55 
 
 		 191 aa  184  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00451  hypothetical protein  53.59 
 
 		 184 aa  184  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001996  hypothetical protein  52.97 
 
 		 184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0788  hypothetical protein  58.2 
 
 		 194 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0760  hypothetical protein  58.6 
 
 		 194 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41260  hypothetical protein  48.42 
 
 		 194 aa  181  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140731  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2497  hypothetical protein  52.43 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  49.74 
 
 		 188 aa  178  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  49.19 
 
 		 189 aa  177  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2409  hypothetical protein  47.83 
 
 		 183 aa  176  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936736  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3626  hypothetical protein  57.3 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1080  membrane protein  52.78 
 
 		 189 aa  176  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0682  hypothetical protein  52.46 
 
 		 184 aa  175  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.634771  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61260  hypothetical protein  61.31 
 
 		 192 aa  174  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0575  hypothetical protein  49.73 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41250  hypothetical protein  60 
 
 		 193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396742  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5275  hypothetical protein  62.58 
 
 		 192 aa  171  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.932867  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  48.63 
 
 		 201 aa  171  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0895  hypothetical protein  49.73 
 
 		 184 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.363973  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3467  hypothetical protein  49.73 
 
 		 184 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950509  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1560  membrane protein-like protein  59.44 
 
 		 190 aa  169  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00722707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3189  hypothetical protein  50.27 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372005  normal  0.740442 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3590  hypothetical protein  49.73 
 
 		 184 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.976053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3880  hypothetical protein  48.66 
 
 		 188 aa  169  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000226161  hitchhiker  0.000000250469 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3391  protein of unknown function UPF0016  49.73 
 
 		 184 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  49.19 
 
 		 187 aa  168  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0640  hypothetical protein  48.92 
 
 		 184 aa  166  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  49.19 
 
 		 205 aa  165  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3939  hypothetical protein  47.31 
 
 		 204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143914  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  48.65 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1071  hypothetical protein  49.18 
 
 		 197 aa  158  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2940  hypothetical protein  49.18 
 
 		 186 aa  157  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.835594  normal  0.0290979 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3028  hypothetical protein  49.73 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.521433 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0946  hypothetical protein  49.18 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0909  hypothetical protein  49.73 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0121906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0914  hypothetical protein  49.73 
 
 		 184 aa  155  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0521  protein of unknown function UPF0016  48.11 
 
 		 187 aa  148  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  41.71 
 
 		 216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  40.84 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  38.1 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  34.04 
 
 		 216 aa  112  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  37.63 
 
 		 215 aa  111  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3202  hypothetical protein  57.43 
 
 		 102 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  34.57 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  34.04 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  40.32 
 
 		 195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  38.01 
 
 		 189 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  34.39 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  38.38 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0125  protein of unknown function UPF0016  37.63 
 
 		 235 aa  101  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0237504  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10240  predicted membrane protein  35.6 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>