37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1772 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1772  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  348  2e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0888  hypothetical protein  48.59 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2648  hypothetical protein  48.59 
 
 		 180 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.3572  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1305  hypothetical protein  48.02 
 
 		 180 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2688  hypothetical protein  46.89 
 
 		 179 aa  134  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1184  hypothetical protein  48.59 
 
 		 180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430255  normal  0.82383 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1953  hypothetical protein  45.76 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4762  hypothetical protein  44.96 
 
 		 191 aa  108  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3463  hypothetical protein  43.94 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3751  hypothetical protein  38.75 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3977  hypothetical protein  43.41 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4436  hypothetical protein  35.36 
 
 		 189 aa  97.8  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.713232  normal  0.574108 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0233  hypothetical protein  39.39 
 
 		 190 aa  90.9  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3278  hypothetical protein  33.71 
 
 		 192 aa  90.1  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.423903  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0694  hypothetical protein  40.6 
 
 		 189 aa  89.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0775064  normal  0.515719 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1613  hypothetical protein  39.39 
 
 		 190 aa  89.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.496834  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3384  hypothetical protein  37.5 
 
 		 188 aa  85.5  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2638  hypothetical protein  40.15 
 
 		 190 aa  84.7  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8220  hypothetical protein  31.64 
 
 		 192 aa  84  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4152  hypothetical protein  34.48 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1505  hypothetical protein  34.36 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00633396  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2343  hypothetical protein  33.78 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000144588  unclonable  0.000000152413 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1266  hypothetical protein  33.78 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4163  hypothetical protein  35.81 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0941448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3977  hypothetical protein  40.18 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.289017 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1857  hypothetical protein  39.68 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1636  hypothetical protein  45.95 
 
 		 186 aa  70.9  0.000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03460  hypothetical protein  40.83 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3923  hypothetical protein  39.55 
 
 		 196 aa  67  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835574  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4423  hypothetical protein  39.85 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0847  hypothetical protein  39.71 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0803  hypothetical protein  30.34 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.806427  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0337  hypothetical protein  37.59 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8411  hypothetical protein  31.88 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1588  hypothetical protein  31.54 
 
 		 204 aa  47.8  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0073  hypothetical protein  33.09 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2631  PilT domain-containing protein  38.89 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996452  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>