More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1937 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  65.15 
 
 		 686 aa  964    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  46.94 
 
 		 692 aa  650    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  47.96 
 
 		 697 aa  646    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  64.71 
 
 		 686 aa  958    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  100 
 
 		 685 aa  1408    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2103  elongation factor G  62.23 
 
 		 688 aa  896    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  49.28 
 
 		 691 aa  653    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  47.51 
 
 		 694 aa  637    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  61.58 
 
 		 687 aa  875    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  63.84 
 
 		 688 aa  920    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  48.46 
 
 		 701 aa  647    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  48.46 
 
 		 697 aa  660    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  51.53 
 
 		 691 aa  701    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  48.6 
 
 		 694 aa  658    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  47.82 
 
 		 697 aa  629  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  48.46 
 
 		 701 aa  631  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  43.91 
 
 		 690 aa  577  1.0000000000000001e-163  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.3 
 
 		 682 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  42.79 
 
 		 695 aa  569  1e-161  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  42.48 
 
 		 692 aa  563  1.0000000000000001e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  43.38 
 
 		 701 aa  562  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  44.18 
 
 		 679 aa  560  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  41.42 
 
 		 692 aa  555  1e-157  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  40.99 
 
 		 696 aa  554  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  40.88 
 
 		 696 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  41.63 
 
 		 692 aa  551  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  42.27 
 
 		 694 aa  551  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  42.1 
 
 		 696 aa  547  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  41.46 
 
 		 692 aa  546  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  40.56 
 
 		 697 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  42.84 
 
 		 670 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  42.39 
 
 		 696 aa  548  1e-154  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  41.11 
 
 		 692 aa  542  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  39.97 
 
 		 697 aa  545  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  44.43 
 
 		 680 aa  543  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  39.97 
 
 		 697 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  41.35 
 
 		 695 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  40.2 
 
 		 691 aa  538  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2327  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  40.41 
 
 		 697 aa  534  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000709342  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  41.78 
 
 		 673 aa  531  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  39.77 
 
 		 691 aa  530  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  39.56 
 
 		 697 aa  530  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  40.76 
 
 		 692 aa  531  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4111  small GTP-binding protein  41.8 
 
 		 697 aa  526  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902379 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  40.32 
 
 		 689 aa  527  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  39.36 
 
 		 699 aa  526  1e-148  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  41.27 
 
 		 667 aa  525  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  39.36 
 
 		 699 aa  524  1e-147  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  40.18 
 
 		 689 aa  523  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2172  translation elongation factor G  39.65 
 
 		 698 aa  524  1e-147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.063609  normal  0.792928 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  40.79 
 
 		 691 aa  525  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0124  translation elongation factor G  40.52 
 
 		 707 aa  522  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  39.21 
 
 		 697 aa  523  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  40.56 
 
 		 689 aa  520  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  39.97 
 
 		 697 aa  519  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03950  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  40.93 
 
 		 698 aa  519  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  40.41 
 
 		 691 aa  521  1e-146  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  39.59 
 
 		 697 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  39 
 
 		 689 aa  521  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  38.54 
 
 		 693 aa  519  1e-146  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  38.98 
 
 		 692 aa  520  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  38.39 
 
 		 692 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  39.28 
 
 		 693 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  38.3 
 
 		 691 aa  516  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  39.94 
 
 		 695 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2403  elongation factor G  39.97 
 
 		 688 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149937  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  38.23 
 
 		 692 aa  513  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  38.35 
 
 		 698 aa  512  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  38.48 
 
 		 692 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  39.59 
 
 		 691 aa  514  1e-144  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2717  elongation factor G  39.68 
 
 		 688 aa  513  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  38.14 
 
 		 692 aa  512  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  39.65 
 
 		 691 aa  514  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  39.74 
 
 		 691 aa  511  1e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  40.14 
 
 		 701 aa  510  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  39.59 
 
 		 691 aa  510  1e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  38.77 
 
 		 690 aa  509  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0212  elongation factor G  39.91 
 
 		 692 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232583  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  39.62 
 
 		 691 aa  511  1e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  39.42 
 
 		 701 aa  510  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3277  elongation factor G  39.07 
 
 		 701 aa  509  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0394176  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  38.52 
 
 		 691 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  39.44 
 
 		 691 aa  509  1e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  39.59 
 
 		 701 aa  506  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  39.44 
 
 		 688 aa  507  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  38.33 
 
 		 692 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  38.21 
 
 		 691 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  38.55 
 
 		 696 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  40.06 
 
 		 700 aa  507  9.999999999999999e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  38.75 
 
 		 697 aa  507  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  38.21 
 
 		 691 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  38.3 
 
 		 692 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  40.42 
 
 		 682 aa  506  9.999999999999999e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  38.32 
 
 		 698 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  0.0000000723027 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  39.42 
 
 		 701 aa  504  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  38.61 
 
 		 698 aa  503  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  37.32 
 
 		 692 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  37.03 
 
 		 692 aa  503  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0181  elongation factor G  38.17 
 
 		 698 aa  503  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000344622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0419  elongation factor G  37.85 
 
 		 692 aa  504  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000206577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>