More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1646 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
259 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.23 
 
 
276 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.53 
 
 
259 aa  225  7e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.832577  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4930  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.08 
 
 
267 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.66 
 
 
283 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4887  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.76 
 
 
296 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0123695  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1078  ABC transporter, nitrate-like  45.49 
 
 
275 aa  191  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193306  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0466  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.42 
 
 
262 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.8 
 
 
296 aa  188  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.159688 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.32 
 
 
275 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.62 
 
 
257 aa  182  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.51 
 
 
294 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.39 
 
 
289 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0761961  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2719  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.15 
 
 
284 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.15 
 
 
291 aa  181  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.582448  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
267 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
257 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369486  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.53 
 
 
275 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.142025  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1488  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.42 
 
 
280 aa  174  9e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106569  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  41.67 
 
 
282 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.67 
 
 
282 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.285231  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.75 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1046  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44 
 
 
282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12004  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  39.73 
 
 
253 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  39.73 
 
 
253 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  39.73 
 
 
283 aa  161  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  39.73 
 
 
285 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  39.73 
 
 
283 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  39.73 
 
 
283 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0155  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.13 
 
 
292 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
275 aa  158  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197989  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.35 
 
 
257 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.214609  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6456  ABC transporter permease  41.27 
 
 
258 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  39.41 
 
 
283 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.7 
 
 
279 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
254 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.3 
 
 
279 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.75 
 
 
306 aa  152  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17867  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5517  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16627  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  37.71 
 
 
285 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1470  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.8 
 
 
301 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4060  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.78 
 
 
256 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.93 
 
 
275 aa  149  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 
321 aa  149  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  37.18 
 
 
274 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.99 
 
 
279 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0692  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  38.91 
 
 
306 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000618741  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  37.6 
 
 
279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
323 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.226274  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
257 aa  145  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
324 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0488095  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
324 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
324 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6225  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  38.98 
 
 
320 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  39.04 
 
 
275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
279 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
357 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0334046  normal  0.137928 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1386  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  36.4 
 
 
323 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173943  normal  0.101646 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0049  ABC taurine transporter, binding protein inner membrane component  36.51 
 
 
330 aa  144  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  34.92 
 
 
273 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
273 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
320 aa  143  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 
353 aa  143  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.19574 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.08 
 
 
259 aa  142  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4207  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  39.37 
 
 
289 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
353 aa  142  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  38.03 
 
 
274 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2477  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
289 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0948255  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0085  taurine ABC transporter inner membrane protein  38.61 
 
 
283 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.135193 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.76 
 
 
289 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 
262 aa  142  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.577279 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.37 
 
 
321 aa  141  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.905374 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  37.56 
 
 
274 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
273 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
273 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
289 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  37.28 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.59 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.61 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
274 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
268 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
412 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  34.69 
 
 
273 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  37.13 
 
 
284 aa  137  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.88 
 
 
277 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 
265 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  37.13 
 
 
284 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 
296 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.201741 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  37.13 
 
 
284 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2566  ABC transporter, membrane subunit  35.9 
 
 
252 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0409101  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
306 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
284 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7166  taurine uptake ABC transporter permease protein  39.38 
 
 
261 aa  135  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>