More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0026 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0026  ABC transporter related  100 
 
 		 273 aa  563  1e-160  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2209  ATPase  52.73 
 
 		 271 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.412133  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1726  ABC transporter related  53.75 
 
 		 268 aa  229  3e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0623  ABC transporter related  43.51 
 
 		 294 aa  226  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0118  ABC transporter related  50.78 
 
 		 308 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.4303 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  45.04 
 
 		 258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  47.41 
 
 		 257 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  44.54 
 
 		 249 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  44.77 
 
 		 257 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1014  ABC transporter related protein  43.62 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  46.26 
 
 		 250 aa  209  5e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2422  ABC transporter, ATPase subunit  42.98 
 
 		 243 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  38.98 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  38.98 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  44.91 
 
 		 243 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  44.69 
 
 		 251 aa  203  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  44.23 
 
 		 254 aa  201  8e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.93 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.93 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  45.15 
 
 		 254 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  41 
 
 		 281 aa  189  5e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  42.86 
 
 		 251 aa  188  7e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  46.23 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1890  ABC-type zinc transport system ATP-binding protein  41.59 
 
 		 262 aa  184  9e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  47.24 
 
 		 222 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  42.92 
 
 		 250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 		 256 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 		 256 aa  182  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 		 256 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 		 256 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 		 256 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 		 256 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.5 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  39.58 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  39.82 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0517  manganese transport system ATP-binding protein MntA  38.82 
 
 		 273 aa  178  8e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1675  ATPase  47.98 
 
 		 233 aa  178  8e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000905168  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0130  ABC transporter related protein  38.14 
 
 		 253 aa  178  8e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  38.33 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  42.92 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  38.89 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1791  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.75 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0995  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  44.23 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0155  cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  39.91 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  39.92 
 
 		 259 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  38.77 
 
 		 252 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  41.59 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1729  ABC transporter ATP-binding protein  36.1 
 
 		 251 aa  168  9e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  38.53 
 
 		 262 aa  168  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  37.82 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  37.55 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0137  cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.75 
 
 		 284 aa  165  6.9999999999999995e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  37.84 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  41.67 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0178  cation ABC transporter, ATP-binding protein  37.18 
 
 		 284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3806  ABC transporter related protein  41.15 
 
 		 221 aa  163  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000628307  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  40.43 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0852  ABC transporter related  40.81 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.478961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1687  ABC transporter related protein  37.55 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  35.44 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  40.38 
 
 		 244 aa  158  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  36.21 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  39.61 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0038  cation ABC transporter, ATP-binding protein  40.76 
 
 		 249 aa  156  4e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  43.48 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  38.79 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  38.35 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  35.81 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  35.78 
 
 		 247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  39.61 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  37.34 
 
 		 250 aa  152  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  36.13 
 
 		 251 aa  152  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  38.14 
 
 		 254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  41.06 
 
 		 247 aa  152  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  36.74 
 
 		 263 aa  151  8.999999999999999e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  36.55 
 
 		 259 aa  151  8.999999999999999e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  37.38 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3479  ABC transporter related protein  39.18 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319887  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 230 aa  151  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2985  ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  35.81 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  37.38 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  37.86 
 
 		 249 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  37.86 
 
 		 249 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  35 
 
 		 250 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  36.41 
 
 		 245 aa  149  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2552  ABC transporter related  36.28 
 
 		 252 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  39.62 
 
 		 250 aa  149  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  39.59 
 
 		 263 aa  149  6e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  38.1 
 
 		 248 aa  148  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  36.52 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0492  ABC transporter-related protein  35.8 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  40.67 
 
 		 251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 254 aa  148  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  37.81 
 
 		 240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  36.62 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>