268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0247 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  100 
 
 
269 aa  532  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  43.02 
 
 
267 aa  232  5e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  43.56 
 
 
268 aa  226  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  44.49 
 
 
270 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  40.6 
 
 
268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  41.22 
 
 
269 aa  222  6e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  40.6 
 
 
268 aa  221  7e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  43.46 
 
 
263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  43.46 
 
 
263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  44.87 
 
 
265 aa  209  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  41.77 
 
 
262 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  46.31 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  38.08 
 
 
262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  41.8 
 
 
264 aa  196  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  42.4 
 
 
264 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  42.4 
 
 
264 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  40.46 
 
 
264 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  41.37 
 
 
264 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  41.37 
 
 
264 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  41.37 
 
 
264 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  41.37 
 
 
264 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  41.37 
 
 
264 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  43.44 
 
 
265 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  38.93 
 
 
264 aa  191  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  38.22 
 
 
264 aa  190  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  41.39 
 
 
264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  36.48 
 
 
268 aa  188  5.999999999999999e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  36.48 
 
 
268 aa  188  5.999999999999999e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  39.45 
 
 
259 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  37.92 
 
 
268 aa  186  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  39.7 
 
 
269 aa  186  5e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  33.85 
 
 
267 aa  185  7e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  44.4 
 
 
266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  38.71 
 
 
266 aa  179  4e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  38.4 
 
 
271 aa  176  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  36.63 
 
 
265 aa  176  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  32.57 
 
 
263 aa  175  7e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  37.02 
 
 
271 aa  171  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  36.15 
 
 
266 aa  169  3e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  36.48 
 
 
267 aa  169  4e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  37.05 
 
 
264 aa  166  5e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  42.28 
 
 
264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2470  cobalt transport protein  38.31 
 
 
275 aa  159  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105266  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2300  cobalt ABC transporter permease protein  38.15 
 
 
263 aa  159  6e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000489641  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  36.07 
 
 
264 aa  150  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0320  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  37.96 
 
 
267 aa  148  8e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00398229  hitchhiker  1.85295e-17 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  36.89 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  35.19 
 
 
255 aa  144  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  31.51 
 
 
332 aa  142  6e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12580  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  37.45 
 
 
269 aa  142  7e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  31.92 
 
 
246 aa  139  7e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0997  cobalt transport protein  37.21 
 
 
264 aa  138  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  normal  0.445886 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  30 
 
 
336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24080  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  37.02 
 
 
266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  31.08 
 
 
770 aa  132  6.999999999999999e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  29.5 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  37.17 
 
 
810 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0352  cobalt transport protein  33.72 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1836  cobalt transport protein  28.99 
 
 
244 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.507525  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  35.8 
 
 
438 aa  118  9.999999999999999e-26  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1964  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit  31.06 
 
 
255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  34.38 
 
 
257 aa  113  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2799  cobalt transport protein  30.99 
 
 
284 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161091  hitchhiker  0.0000401783 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  29.07 
 
 
259 aa  102  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf374  cobalt ABC transporter, permease protein  30.38 
 
 
314 aa  97.8  2e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004205  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  30.23 
 
 
255 aa  93.2  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1751  cobalt transport protein  31.08 
 
 
272 aa  91.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253796  normal  0.0321598 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  25.32 
 
 
252 aa  91.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  32.58 
 
 
261 aa  90.1  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19680  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  35.1 
 
 
231 aa  89  7e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0554754  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2867  cobalt transport protein  29.29 
 
 
290 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3229  cobalt transport protein  29.29 
 
 
290 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.500857 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  29.05 
 
 
310 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  29.17 
 
 
276 aa  85.9  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1539  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  27.46 
 
 
278 aa  85.5  7e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1501  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  25 
 
 
293 aa  85.5  9e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  28.04 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0884  cobalt transport protein  27.61 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1229  cobalt transport protein  34.46 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.379694 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01470  Cobalt transport protein  24.25 
 
 
350 aa  84  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0260035  normal  0.244881 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0337  cobalt transport protein  29.37 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  27.45 
 
 
257 aa  82  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  26.79 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  27.57 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  28.95 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  30.77 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  28.85 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  28.79 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1130  cobalt transport protein  28.87 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1972  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  25.48 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1950  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporters-like protein  26.59 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1768  ABC transporter, permease protein  27.41 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.689624  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  27.27 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  27.27 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  31.61 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  29.59 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0369  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  29.66 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2485  cobalt transport protein  27.89 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1608  cobalt transport protein  28.57 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2764  cobalt transport protein  25.39 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>