93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0055 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0055  spore germination protein  100 
 
 		 369 aa  727    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0296  spore germination protein  45.23 
 
 		 385 aa  275  7e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2166  spore germination protein  31.97 
 
 		 370 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.444413  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0781  spore germination protein  30 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3656  spore germination protein  28.76 
 
 		 365 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0136  spore germination protein  28.97 
 
 		 365 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00122585  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2279  spore germination protein  29.22 
 
 		 361 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.594661  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0603  spore germination protein  25.75 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.18587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1460  spore germination protein  28.14 
 
 		 363 aa  120  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2565  spore germination protein  27.1 
 
 		 357 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.760269 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2466  spore germination protein  28.83 
 
 		 367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1192  hypothetical protein  23.8 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2041  spore germination protein  29 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3200  hypothetical membrane protein  30.98 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2711  spore germination protein  23.76 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3365  spore germination protein  25.85 
 
 		 360 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000593195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0802  spore germination protein  24.7 
 
 		 369 aa  103  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3283  spore germination protein  26.45 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3011  spore germination protein  25.07 
 
 		 368 aa  99.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0051  spore germination protein  23.59 
 
 		 359 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0873  spore germination protein  27.56 
 
 		 362 aa  89.4  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3137  spore germination protein A2  24.7 
 
 		 363 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2852  spore germination protein; amino acid permease  25 
 
 		 363 aa  87  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000387723  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3166  spore germination protein A2  25 
 
 		 363 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2102  spore germination protein A2  24.4 
 
 		 363 aa  87  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0135  spore germination protein KB  24.63 
 
 		 363 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0786336  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3159  spore germination protein A2  24.7 
 
 		 363 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.165697 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3655  spore germination protein  25.26 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2766  spore germination protein  24.41 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000369492  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2903  spore germination protein  24.27 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161423  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0079  hypothetical protein  26.92 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0604  spore germination protein  23.85 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1561  spore germination protein  26.56 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.636005  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1955  spore germination protein  22.93 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.226978  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3073  spore germination protein  27.62 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0670  spore germination protein  25.47 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00110  spore germination protein  27.06 
 
 		 365 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1733  spore germination protein  27.01 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0363147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2664  spore germination protein  26.42 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2927  spore germination protein  27.03 
 
 		 306 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495537  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0439  spore germination protein  23.38 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0058  spore germination protein  24.01 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.962325  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2665  spore germination protein  25 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0668  spore germination protein  22.13 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1012  spore germination protein  22.34 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000935312 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0652  spore germination protein  23.65 
 
 		 361 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0844  spore germination protein  22.58 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2954  spore germination protein  29.63 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1970  spore germination protein  21.7 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0074  hypothetical protein  24.4 
 
 		 365 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5574  spore germination protein  22.89 
 
 		 367 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.300189 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3600  spore germination protein  24.89 
 
 		 365 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3683  spore germination protein  25.32 
 
 		 365 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3591  spore germination protein  24.89 
 
 		 365 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0522  Spore germination protein  22.26 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.234591  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2435  spore germination protein  23.08 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3333  spore germination protein; amino acid permease  22.47 
 
 		 365 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3283  spore germination protein; amino acid permease  22.47 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.946646  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2457  spore germination protein  22.19 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0702  spore germination protein GerKB  30.43 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4667  spore germination protein GerKB  29.71 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.310599999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2837  hypothetical protein  28.4 
 
 		 182 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260649  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3583  spore germination protein  22.47 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0664  spore germination protein  33.98 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4845  spore germination protein GerHB  24.88 
 
 		 364 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1011  spore germination protein  23.59 
 
 		 361 aa  47.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0391  spore germination protein GerHB  24.09 
 
 		 364 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1937  spore germination protein  26.52 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0690  spore germination protein GerKB  29.5 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4875  spore germination protein GerHB  24.88 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0601  spore germination protein GerKB  29.5 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3370  spore germination protein  22.03 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0545  spore germination protein  29.5 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4484  spore germination protein IB  24.53 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0634  spore germination protein GerKB  29.5 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3634  spore germination protein  22.03 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0547  spore germination protein  29.5 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0764  spore germination protein KB  29.5 
 
 		 158 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4870  spore germination protein GerHB  25 
 
 		 366 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4564  spore germination protein  22.89 
 
 		 364 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0545  spore germination protein KB  29.5 
 
 		 368 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1708  GerZB  19.53 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000089692 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4985  spore germination protein GerHB  24.88 
 
 		 364 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4465  spore germination protein IB  24.54 
 
 		 366 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0670  spore germination protein GerKB  29.5 
 
 		 368 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4631  spore germination protein GerHB  24.88 
 
 		 364 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3409  spore germination protein  24.04 
 
 		 364 aa  44.3  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4853  spore germination protein GerHB  24.88 
 
 		 364 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2459  spore germination protein  25.87 
 
 		 364 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2340  spore germination protein  20 
 
 		 367 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00328418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2754  spore germination protein XB  31.63 
 
 		 363 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0830054  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1633  spore germination protein  25.35 
 
 		 365 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0156  spore germination protein xb  29.52 
 
 		 355 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>