161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3449 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3449  phosphopentomutase  100 
 
 		 388 aa  790    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1100  phosphopentomutase  60.82 
 
 		 397 aa  501  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0677  phosphopentomutase  60.82 
 
 		 388 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1773  phosphopentomutase  61.24 
 
 		 390 aa  489  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0408  phosphopentomutase  62.11 
 
 		 389 aa  488  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1500  phosphopentomutase  60.57 
 
 		 389 aa  483  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3205  phosphopentomutase  60.1 
 
 		 392 aa  475  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2053  phosphopentomutase  59.33 
 
 		 397 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0758  phosphopentomutase  61.62 
 
 		 390 aa  471  1e-132  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0781  phosphopentomutase  61.88 
 
 		 390 aa  473  1e-132  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1319  phosphopentomutase  59.89 
 
 		 396 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0608  phosphopentomutase  60.57 
 
 		 390 aa  464  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1281  phosphopentomutase  58.51 
 
 		 397 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.477667  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1472  phosphopentomutase  57.36 
 
 		 394 aa  457  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215441  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1667  phosphopentomutase  56.07 
 
 		 392 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.104924  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3719  phosphopentomutase  55.01 
 
 		 390 aa  441  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1791  phosphopentomutase  56.42 
 
 		 392 aa  439  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0037  phosphopentomutase  54.45 
 
 		 391 aa  431  1e-120  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000700156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3997  phosphopentomutase  53.87 
 
 		 394 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3828  phosphopentomutase  53.87 
 
 		 394 aa  426  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0706266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1040  phosphopentomutase  53.87 
 
 		 394 aa  426  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000119876  hitchhiker  0.000224801 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4309  phosphopentomutase  53.87 
 
 		 394 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0282781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4197  phosphopentomutase  53.87 
 
 		 394 aa  425  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00100464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4111  phosphopentomutase  53.87 
 
 		 394 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.25334e-34 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06950  phosphopentomutase  57.39 
 
 		 349 aa  427  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.56293  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3918  phosphopentomutase  53.35 
 
 		 394 aa  425  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000783591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4220  phosphopentomutase  53.61 
 
 		 394 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000013434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4156  phosphopentomutase  53.61 
 
 		 394 aa  424  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3844  phosphopentomutase  53.61 
 
 		 394 aa  424  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.512526  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2256  phosphopentomutase  54.01 
 
 		 393 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0954  phosphopentomutase  55.13 
 
 		 388 aa  421  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0905  phosphopentomutase  54.62 
 
 		 391 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0956  phosphopentomutase  54.62 
 
 		 388 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2786  phosphopentomutase  52.58 
 
 		 395 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000455105  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6094  phosphopentomutase  53.44 
 
 		 420 aa  412  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0951  phosphopentomutase  54.62 
 
 		 389 aa  411  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2320  phosphopentomutase  52.84 
 
 		 392 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000329879  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2847  phosphopentomutase  53.35 
 
 		 391 aa  407  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0368  phosphopentomutase  52.2 
 
 		 393 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0140  phosphopentomutase  51.15 
 
 		 396 aa  400  9.999999999999999e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2314  phosphopentomutase  49.46 
 
 		 385 aa  387  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.932975  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1749  phosphopentomutase  51.8 
 
 		 390 aa  381  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0125  phosphopentomutase  47.94 
 
 		 392 aa  375  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0130  phosphopentomutase  47.94 
 
 		 392 aa  375  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2846  phosphopentomutase  53.39 
 
 		 386 aa  377  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1743  phosphopentomutase  47.68 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0150  phosphopentomutase  52.3 
 
 		 381 aa  371  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.51514  normal  0.178171 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1927  phosphopentomutase  50.49 
 
 		 406 aa  368  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0610  phosphopentomutase  53.58 
 
 		 392 aa  364  1e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0376  phosphopentomutase  47.19 
 
 		 396 aa  360  2e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0371  phosphopentomutase  47.19 
 
 		 396 aa  360  2e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03375  phosphopentomutase  49.51 
 
 		 406 aa  360  3e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0280  phosphopentomutase  48.5 
 
 		 397 aa  359  4e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.240489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0662  phosphopentomutase  50 
 
 		 407 aa  357  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002631  phosphopentomutase  49.27 
 
 		 406 aa  356  3.9999999999999996e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3615  phosphopentomutase  48.77 
 
 		 407 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4930  phosphopentomutase  48.77 
 
 		 407 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4618  phosphopentomutase  48.77 
 
 		 407 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4982  phosphopentomutase  48.77 
 
 		 407 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5898  phosphopentomutase  48.77 
 
 		 407 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0829  phosphopentomutase  49.15 
 
 		 407 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3673  phosphopentomutase  48.77 
 
 		 407 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.863426  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4932  phosphopentomutase  48.77 
 
 		 407 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.912083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3496  phosphopentomutase  49.15 
 
 		 407 aa  352  5.9999999999999994e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3625  phosphopentomutase  49.15 
 
 		 407 aa  352  5.9999999999999994e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.871395  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0586  phosphopentomutase  47.95 
 
 		 392 aa  352  8e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.036632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0621  phosphopentomutase  49.02 
 
 		 406 aa  352  8.999999999999999e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.482863  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3331  phosphopentomutase  49.02 
 
 		 407 aa  351  1e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00236172  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2820  phosphopentomutase  48.77 
 
 		 404 aa  351  1e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.776511  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04259  phosphopentomutase  48.53 
 
 		 407 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4977  phosphopentomutase  48.78 
 
 		 407 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04225  hypothetical protein  48.53 
 
 		 407 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.836281  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0601  phosphopentomutase  49.02 
 
 		 407 aa  350  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4823  phosphopentomutase  48.78 
 
 		 407 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3228  phosphopentomutase  49.01 
 
 		 404 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4891  phosphopentomutase  48.78 
 
 		 407 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0858658  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4925  phosphopentomutase  48.78 
 
 		 407 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.141985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0975  phosphopentomutase  50.49 
 
 		 407 aa  350  3e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.515828  hitchhiker  0.00460474 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3450  phosphopentomutase  49.26 
 
 		 407 aa  350  3e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0823  phosphopentomutase  48.53 
 
 		 407 aa  349  4e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2985  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4984  phosphopentomutase  48.54 
 
 		 407 aa  348  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1142  phosphopentomutase  48.52 
 
 		 404 aa  348  9e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000656152 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0693  phosphopentomutase  48.28 
 
 		 407 aa  348  1e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0543  phosphopentomutase  48.78 
 
 		 407 aa  348  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.284768  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3547  phosphopentomutase  48.28 
 
 		 405 aa  345  6e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0922116  hitchhiker  0.000231976 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1004  phosphopentomutase  47.78 
 
 		 405 aa  345  8e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0676  phosphopentomutase  47.54 
 
 		 407 aa  344  2e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3225  phosphopentomutase  48.28 
 
 		 404 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3364  phosphopentomutase  48.28 
 
 		 404 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  hitchhiker  0.00673377 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1976  phosphopentomutase  46.31 
 
 		 404 aa  342  5e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0351038  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1077  phosphopentomutase  47.26 
 
 		 403 aa  342  8e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4099  phosphopentomutase  49.64 
 
 		 409 aa  342  9e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4181  phosphopentomutase  48.04 
 
 		 406 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4469  phosphopentomutase  47.3 
 
 		 406 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614507  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0229  phosphopentomutase  48.77 
 
 		 406 aa  339  5e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1182  phosphopentomutase  46.4 
 
 		 403 aa  338  7e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2069  phosphopentomutase  46.4 
 
 		 403 aa  338  7e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0253086  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0112  phosphopentomutase  45.55 
 
 		 397 aa  338  9.999999999999999e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000070678  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1934  phosphopentomutase  48.29 
 
 		 406 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3345  phosphopentomutase  47.79 
 
 		 406 aa  336  5e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>