More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2603 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2603  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  100 
 
 
468 aa  932  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0259  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  60.96 
 
 
514 aa  567  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1453  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  64.13 
 
 
461 aa  547  1e-154  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1636  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  62.68 
 
 
490 aa  517  1e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1788  xanthine dehydrogenase, small subunit  56.37 
 
 
467 aa  472  1e-132  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350368  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3660  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  42.28 
 
 
484 aa  343  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807153  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1590  xanthine dehydrogenase, small subunit  42.41 
 
 
484 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.597851 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4278  xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  42.53 
 
 
484 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.513605  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3604  xanthine dehydrogenase, small subunit  42.11 
 
 
484 aa  339  7e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.703198  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3842  xanthine dehydrogenase, small subunit  42.41 
 
 
484 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.977655  normal  0.775119 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1797  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  41.7 
 
 
484 aa  332  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.014868  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1815  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:[2Fe-2S]-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  40.3 
 
 
484 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522719  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2833  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  42.53 
 
 
492 aa  329  8e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0860  xanthine dehydrogenase, small subunit  42.35 
 
 
504 aa  327  2e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3133  xanthine dehydrogenase, small subunit  41.01 
 
 
488 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207802  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2424  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  41.03 
 
 
480 aa  323  5e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1035  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  42.34 
 
 
506 aa  322  6e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.22588  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2704  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  41.6 
 
 
487 aa  320  2e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2751  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  40.79 
 
 
479 aa  320  5e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433722  normal  0.51663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2425  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:(2Fe-2S)-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  40.88 
 
 
500 aa  318  9e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0771886  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2861  xanthine dehydrogenase, small subunit  42.71 
 
 
488 aa  318  9e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0406506  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5002  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  43.24 
 
 
512 aa  317  3e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0711  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  40.87 
 
 
520 aa  313  4e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2300  xanthine dehydrogenase small subunit  42.77 
 
 
476 aa  312  7e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.289203  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02515  putative xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  38.92 
 
 
480 aa  311  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0832  2Fe-2S ferredoxin, iron-sulfur binding site  40.54 
 
 
528 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0348  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  40.54 
 
 
528 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0658875  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0728  xanthine dehydrogenase, small subunit  40.12 
 
 
527 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0804  xanthine dehydrogenase, small subunit  40.33 
 
 
523 aa  308  1e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0950  xanthine dehydrogenase, subunit A  42.21 
 
 
543 aa  308  1e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22290  xanthine dehydrogenase, small subunit  41.24 
 
 
496 aa  308  2e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2246  xanthine dehydrogenase, small subunit  41.25 
 
 
504 aa  307  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1922  xanthine dehydrogenase, small subunit  41.25 
 
 
504 aa  307  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.501378 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1130  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  43.84 
 
 
507 aa  306  6e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.16283  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3948  hypothetical protein  41.27 
 
 
485 aa  306  7e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.804932  normal  0.121566 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0365  xanthine dehydrogenase, small subunit  42.19 
 
 
492 aa  305  9e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3102  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  42.8 
 
 
507 aa  305  1e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238239  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3924  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  40.59 
 
 
516 aa  305  1e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_004310  BR0349  xanthine dehydrogenase, putative  42.19 
 
 
492 aa  304  2e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0893  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  39.96 
 
 
498 aa  303  4e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366411  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2422  xanthine dehydrogenase, small subunit  39.66 
 
 
505 aa  303  4e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  39.87 
 
 
499 aa  303  6e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0451  xanthine dehydrogenase small subunit  39.5 
 
 
496 aa  302  8e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608502  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4499  xanthine dehydrogenase small subunit  40.12 
 
 
496 aa  302  9e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.999061  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44710  xanthine dehydrogenase  42.19 
 
 
484 aa  302  9e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0199275 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0713  xanthine dehydrogenase, small subunit  41.94 
 
 
512 aa  302  9e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2448  xanthine dehydrogenase, small subunit  41.74 
 
 
507 aa  301  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3809  xanthine dehydrogenase  41.95 
 
 
484 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3460  xanthine dehydrogenase, small subunit  42.32 
 
 
530 aa  301  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266307 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2552  xanthine dehydrogenase, small subunit  39.63 
 
 
526 aa  300  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.865646 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3041  xanthine dehydrogenase, small subunit  41.56 
 
 
515 aa  299  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0266852 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0793  xanthine dehydrogenase, small subunit  39.1 
 
 
507 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.229921 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3320  xanthine dehydrogenase  38.28 
 
 
490 aa  298  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151633  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3237  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  40.65 
 
 
485 aa  295  9e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492862  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2095  putative xanthine dehydrogenase (subunit A) oxidoreductase protein  42.51 
 
 
516 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3886  putative xanthine dehydrogenase  37.55 
 
 
507 aa  294  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3554  xanthine dehydrogenase, small subunit  40.45 
 
 
485 aa  292  9e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3907  xanthine dehydrogenase, small subunit  38.01 
 
 
542 aa  292  9e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4257  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  39.29 
 
 
481 aa  289  8e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0226  xanthine dehydrogenase, small subunit  42.15 
 
 
497 aa  288  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.183423  normal  0.106399 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0799  putative xanthine dehydrogenase (subunit A) oxidoreductase protein  42.26 
 
 
515 aa  288  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3759  xanthine dehydrogenase small subunit  42.32 
 
 
467 aa  288  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0499  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  40.3 
 
 
467 aa  288  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.258857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3720  xanthine dehydrogenase, small subunit  39.66 
 
 
493 aa  284  3e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4620  xanthine dehydrogenase small subunit  39.28 
 
 
493 aa  283  4e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5910  xanthine dehydrogenase, small subunit  37.82 
 
 
537 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4864  xanthine dehydrogenase, iron-sulfur binding subunit  35.73 
 
 
494 aa  280  4e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2958  putative xanthine dehydrogenase  39.75 
 
 
483 aa  280  4e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0528227 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2042  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  40.21 
 
 
505 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0871  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  40.21 
 
 
505 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3160  xanthine dehydrogenase, small subunit  40.21 
 
 
505 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3215  xanthine dehydrogenase  40.21 
 
 
505 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.413066  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3199  xanthine dehydrogenase family protein, iron-sulfur-binding/FAD-binding subunit  40.21 
 
 
505 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188115  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1481  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  36.57 
 
 
571 aa  276  8e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0612404 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1155  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  40.29 
 
 
518 aa  275  1e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.874334  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1905  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  40 
 
 
505 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2705  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  40 
 
 
505 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1339  xanthine dehydrogenase, small subunit  41.96 
 
 
501 aa  272  8e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00017372  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1408  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  40.89 
 
 
592 aa  266  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332531  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0937  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  36.34 
 
 
486 aa  260  4e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05613  Xanthine dehydrogenase (EC 1.17.1.4)(Purine hydroxylase I) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12553]  32.46 
 
 
1363 aa  251  3e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  0.0769199 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1789  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  41.43 
 
 
484 aa  249  8e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1140  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.66 
 
 
552 aa  245  1e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.578898  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0433  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  34.9 
 
 
450 aa  226  5e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.649108  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6765  (2Fe-2S)-binding domain protein  31.51 
 
 
470 aa  206  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2224  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  41.89 
 
 
289 aa  163  8e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.844941  hitchhiker  0.000850669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2539  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  38.95 
 
 
287 aa  150  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0444448  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1334  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  39.25 
 
 
295 aa  139  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332436 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2153  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  31.39 
 
 
292 aa  137  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.891805 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0029  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  36.74 
 
 
288 aa  137  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.275591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2774  xanthine dehydrogenase, FAD-binding protein, putative  37.69 
 
 
291 aa  135  1e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0777  xanthine dehydrogenase, FAD-binding protein, putative  35.98 
 
 
288 aa  135  1e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0920  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  35.98 
 
 
288 aa  135  1e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.815419  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3389  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  38.35 
 
 
286 aa  135  2e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2413  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  38.2 
 
 
276 aa  132  1e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2144  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  35.85 
 
 
288 aa  130  5e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102712 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09178  conserved hypothetical protein  30.58 
 
 
1350 aa  129  1e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1738  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  29.28 
 
 
305 aa  128  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2185  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  31.89 
 
 
292 aa  127  4e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.27538  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1735  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  43.21 
 
 
157 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>